针对您提出的“借款已经超过三年怎么起诉”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、确认诉讼时效情况
首先，您需要确认借款是否已经超过法律规定的诉讼时效。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。但这里有几个关键点需要注意：
诉讼时效中断：如果在三年内，您曾向借款人提出过履行请求（如通过微信、短信、书面催款函等方式催讨），或者借款人同意履行义务，那么诉讼时效会中断，并从中断时起重新计算三年。
诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍导致您不能行使请求权，诉讼时效会中止。待障碍消除后，诉讼时效继续计算。
最长保护期：即使存在诉讼时效中断或中止的情形，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院将不再予以保护。
二、准备充分的证据材料
在确认诉讼时效未过期或存在中断、中止情形后，您需要准备充分的证据材料来支持您的诉讼请求。这些证据材料包括但不限于：
直接证据：如借条或借款合同，这些文件应明确借款金额、用途、利息、日期及还款时间等关键信息。
交付证明：如银行转账记录、微信/支付宝转账截图等，这些证据可以证明借款已经实际交付给借款人。
沟通记录：如微信聊天记录、通话录音等，这些记录可以证明借款事实的存在以及双方之间的约定和催讨情况。
身份证明：提供原被告双方的身份证复印件或身份信息查询结果，以确认双方的身份。
三、选择正确的管辖法院
接下来，您需要选择正确的管辖法院来提起诉讼。一般来说，您可以向被告住所地（户籍所在地或经常居住地）或合同履行地（接收货币一方所在地）的人民法院提起诉讼。如果被告的经常居住地与户籍地不一致，您可以选择向经常居住地的人民法院起诉。
四、正式提交起诉材料并参与诉讼程序
提交起诉材料：将起诉状及所有准备好的证据材料提交至有管辖权的法院立案庭。法院将审查您的材料并决定是否立案。
参与庭审：如果法院决定立案，您将需要按时参加庭审。在庭审过程中，您需要遵守法庭纪律，如实陈述事实，提供证据，并对对方的证据进行质证和辩论。
等待判决：庭审结束后，法院将审理案件并作出判决。如果您对判决结果不服，可以在法定期限内提起上诉。
五、考虑非诉讼方式解决
在提起诉讼之前，您也可以考虑通过协商、调解等非诉讼方式来解决借款纠纷。这些方式可能更加灵活、高效，并且有助于维护双方之间的关系。
六、执行判决
如果您胜诉后借款人未主动履行判决，您需要在法定期限内申请强制执行。法院将采取查封财产、冻结账户等措施来帮助您实现债权。
综上所述，借款已经超过三年仍然可以起诉，但您需要仔细确认诉讼时效情况、准备充分的证据材料、选择正确的管辖法院、正式提交起诉材料并参与诉讼程序。同时，您也可以考虑非诉讼方式来解决纠纷，并在胜诉后及时申请强制执行。希望这些解答能对您有所帮助。