工程层层分包，尤其是违法分包，将面临严重的法律后果，这些后果涵盖民事责任、行政责任以及刑事责任等多个方面。以下是对这一问题的详细分析：
民事责任
质量问题的责任承担：
- 根据《中华人民共和国民法典》第八百零二条，因承包人原因导致的工程质量问题，承包人需承担赔偿责任。在违法分包的情况下，若分包人无资质或不具备相应能力，导致工程质量问题，总承包人作为合同的主要责任方，往往需要对业主进行赔偿。例如，在一个住宅项目中，基础工程被违法分包给无资质的施工队，结果导致墙体开裂，总承包人就需要承担赔偿业主损失的责任。
质量整改费用与工期延误：
- 如果工程质量不达标，需要进行整改，那么违法分包的总承包人还需要承担整改费用。此外，如果因整改导致工期延误，总承包人还可能面临工期延误的赔偿责任。比如，在一个道路工程中，路面平整度不符合要求，总承包人就需要自行承担返工的费用，并可能因工期延误而赔偿业主的损失。
合同效力的影响：
- 违法分包的建设工程施工合同是无效的。如果工程质量合格，承包人可以参照合同约定要求支付工程款；但如果工程质量不合格且无法修复，承包人则无法获得工程款，并可能需要赔偿损失。例如，一个建筑工程因违法分包被认定合同无效，如果工程质量合格，分包人可以按照约定要求支付工程款；但如果工程质量不合格，分包人则无法获得工程款，并可能需要赔偿总承包人的损失。
行政责任
资质降级或吊销：
- 根据《建筑业企业资质管理规定》，违法分包可能导致企业资质降级或吊销。这将限制企业承接业务的范围，影响企业的市场竞争力。比如，某建筑企业因多次违法分包，其资质等级从一级降为二级，这将严重影响其承接大型工程的能力。
罚款与停业整顿：
- 《建设工程质量管理条例》规定，违法分包可被处以工程合同价款0.5%至1%的罚款。此外，企业还可能被责令停业整顿，期间不能承接新项目，这将严重影响企业的经营发展。例如，某建筑公司因违法分包被停业整顿3个月，期间无法承接新项目，导致经济损失严重。
刑事责任
- 工程重大安全事故罪：
- 如果违法分包导致重大安全事故，造成人员伤亡或财产损失，相关责任人可能触犯《中华人民共和国刑法》第一百三十七条规定的工程重大安全事故罪。根据该条款，对直接责任人员，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；后果特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。例如，在一个桥梁工程中，因违法分包导致桥梁坍塌事故，造成多人死亡，相关责任人就被追究了刑事责任。
综合影响
扰乱市场秩序：
- 违法分包破坏了建筑市场的公平竞争原则，让无资质或不具备相应能力的企业参与工程建设，损害了有实力和信誉的企业的利益。这不仅降低了整个行业的水平，还可能威胁到公共利益。
社会信任危机：
- 频繁的质量问题和安全事故会引发公众对建筑行业的信任危机，影响社会的稳定和谐。因此，必须坚决打击违法分包行为，维护建筑市场的公平竞争和健康发展。
综上所述，工程层层分包，尤其是违法分包，将面临严重的法律后果。这些后果不仅涉及民事责任、行政责任，还可能涉及刑事责任。因此，建议企业在承接工程时，务必遵守相关法律法规，避免违法分包行为的发生。如果你有任何关于建设工程领域的法律问题，都可以直接向我咨询。