结论前置：员工离职时，工资的结清时间主要依据《工资支付暂行规定》和《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，以及劳动合同中的具体约定来确定。一般情况下，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次性付清劳动者工资；若有特别约定且不违反法律法规，则按约定执行。

一、法律规定与基本原则

根据《工资支付暂行规定》第九条及《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位负有在解除或终止劳动合同的同时一次性付清劳动者工资的义务。这一规定旨在保障劳动者的合法权益，确保其付出劳动后能及时获得应得的报酬。

二、实际情况下的处理

1. 有约定的情况：

   • 若劳动合同或其他书面协议中明确约定了离职后工资结清的具体时间，且该约定不违反法律法规的强制性规定，用人单位应按此约定向劳动者支付工资。例如，双方约定工资在离职后的次月正常发薪日一并发放，只要这种约定是双方真实意思的表示，即为合法有效。但需注意，这种约定不能违反法律法规中关于工资支付时间的基本原则。

2. 无约定的情况：

   • 在没有特定约定的情况下，劳动者依法办理离职手续并完成工作交接等必要程序后，用人单位应即时或在近期内结清工资。通常，这意味着在劳动者提前通知用人单位并履行完离职相关手续后，用人单位需在离职当日或随后几天内完成工资结算。例如，若员工因个人原因提前30日以书面形式通知用人单位解除劳动合同，待30日期满且员工完成离职交接手续后，用人单位必须即时支付剩余工资。

3. 特殊情况的处理：

   • 若员工因用人单位存在未足额支付工资、未依法缴纳社会保险费等违法行为而辞职，除结清工资外，用人单位还可能需按照员工在本单位的工作年限支付经济补偿金，标准为每满一年支付一个月工资。
   • 若用人单位违法解除劳动合同，同样需在离职时结清工资，不得无故拖欠。
   • 在遭遇不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他特殊原因导致用人单位无法按时结清工资时，用人单位应与劳动者进行友好协商，共同确定一个合理的支付时间，并在该期限内尽快完成支付。

三、未及时结清工资的法律后果

• 劳动监察部门介入：若用人单位未按时结清工资，劳动者可向劳动保障监察部门投诉。监察部门将调查并责令用人单位限期支付，逾期不支付的可加付赔偿金（应付金额的50%-100%）。
• 劳动者的维权途径：劳动者可与用人单位协商；协商不成，可向劳动争议调解仲裁机构申请调解仲裁；对仲裁裁决不服的，可向人民法院提起诉讼。如用人单位逾期仍不支付，劳动者还可申请法院强制执行。

四、离职前的建议

• 在离职前，建议劳动者与用人单位协商明确工资结算的时间和方式，并在劳动合同中约定相关条款，以确保权益得到更好保障。同时，劳动者应妥善保留相关证据，如工资条、考勤记录、沟通记录、劳动合同等，以便在维权时提供有力支持。

五、其他相关权益

• 除工资外，劳动者还应注意经济补偿金、社会保险关系转移等其他与离职相关的权益。如有疑问或需要帮助，可直接向我咨询。

综上所述，员工离职后工资的结清时间需遵循法律法规的基本原则，并结合劳动合同中的具体约定来确定。在遇到纠纷时，劳动者应了解自身的权利与维权途径，积极采取措施保护自己的合法权益。