在发生交通事故时，电动车自行车没有合格证和行驶证，但持有买车发票，这种情况下，发票虽然能证明车辆的购买来源，但在法律层面上，它并不能完全替代合格证和行驶证的作用。下面我详细为你解释一下这个问题：

1. 合格证的重要性：合格证是车辆质量合格的证明，是车辆能够合法上路行驶的基本条件之一。没有合格证，可能意味着车辆存在质量隐患，这在交通事故的责任判定中可能会成为一个不利因素。

2. 行驶证的作用：行驶证是车辆合法上路行驶的凭证，包含了车辆的基本信息、车主信息等。在交通事故处理中，行驶证是判断车辆是否合法上路、车主身份等的重要依据。

3. 买车发票的局限性：虽然买车发票能证明你购买了这辆电动车自行车，但它并不能证明车辆的质量是否合格，也不能替代行驶证的法律地位。在交通事故处理中，发票可能只能作为辅助证据，用于证明车辆的购买情况。

4. 法律后果：如果你的电动车自行车没有合格证和行驶证，在发生交通事故时，可能会面临更多的法律责任和风险。比如，在责任判定上，你可能会因为车辆不合法而承担更多的责任；在赔偿问题上，没有合法手续的车辆可能难以获得全额赔偿。

综上所述，虽然持有买车发票能在一定程度上证明车辆的购买情况，但在交通事故处理中，合格证和行驶证才是更为关键的法律凭证。因此，我建议你尽快补办这些证件，以确保你的车辆能够合法上路行驶，并在发生交通事故时能够依法维护自己的权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。