当借款纠纷超过诉讼时效后，法院在处理此类案件时会遵循一系列法律原则和程序。以下是对这一问题的详细解答：

一、诉讼时效的基本概念与法律效果

诉讼时效是指权利人在一定期间内不行使权利，即在某种程度上丧失请求利益的时效制度。对于借款纠纷，通常适用《中华人民共和国民法典》中规定的三年普通诉讼时效期间（特殊情况可能有所不同）。若债权人在该期间内未向债务人主张权利或提起诉讼，则可能因超过诉讼时效而面临不利后果，具体表现为：

1. 抗辩权产生：债务人在诉讼时效期间届满后，有权以诉讼时效已过为由进行抗辩，拒绝履行还款义务。
2. 胜诉权丧失：债权人虽然债权本身并未消灭，但丧失了通过司法途径强制债务人履行债务的胜诉权。

二、法院的处理方式

1. 立案受理：

   • 法院在受理借款纠纷案件时，不会主动审查诉讼时效问题。只要案件符合立案条件，即具有明确的被告、具体的诉讼请求和事实、理由，并且属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖，法院就会受理该案件。

2. 审理阶段：

   • 被告未提出诉讼时效抗辩：
     • 法院将正常审理案件，全面审查原告提供的证据，以查明借款事实及其主张的权利是否合法合理。
     • 如果原告能够充分证明其权利，法院可能会支持原告的诉讼请求，判决被告偿还借款本息等。
   • 被告提出诉讼时效抗辩：
     • 法院将重点审查诉讼时效是否已经届满，以及是否存在诉讼时效中止、中断或延长的法定事由。
     • 如果经审查确认借款确实已经过了诉讼时效，且不存在任何导致诉讼时效中止、中断或延长的法定事由，法院将判决驳回原告的诉讼请求。
     • 如果法院发现存在诉讼时效中止、中断或延长的法定事由，如不可抗力导致无法行使请求权、权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等，那么诉讼时效可能并未届满。此时，法院将继续审理案件，并根据具体情况作出相应的判决。

3. 判决后的救济：

   • 如果原告对法院驳回诉讼请求的判决不服，认为存在未被法院认定的诉讼时效中止、中断等事由，或者有其他合理理由，可以在法定上诉期内向上一级人民法院提起上诉。
   • 上级法院将对案件进行重新审理和裁判，以确保案件的公正性和合法性。

三、法律意义与建议

• 诉讼时效的法律意义：诉讼时效是法律赋予债务人的抗辩权，旨在督促债权人及时行使权利，维护交易秩序的稳定。一旦诉讼时效届满，债务人即可获得时效抗辩权，有权拒绝履行义务。
• 对债权人的建议：债权人应及时行使权利，密切关注借款合同的还款期限，并在必要时采取法律措施维护自己的合法权益。在诉讼时效期间内提起诉讼，可以确保自己的债权得到法律的保护。
• 对债务人的建议：债务人也应了解诉讼时效的相关规定，以便在必要时提出抗辩，维护自己的合法权益。同时，如果条件允许，债务人也可以主动与债权人协商解决借款纠纷，以避免不必要的法律纠纷和损失。

综上所述，借款超过诉讼时效后，法院会依法受理并审理案件，但判决结果取决于被告是否提出诉讼时效抗辩以及抗辩是否成立。因此，债权人和债务人都应充分了解诉讼时效的相关规定，并在必要时采取相应的法律措施。