事业人员在立案期间，其工资待遇的处理需根据具体情况来确定，主要包括以下几种情况：

1. 涉嫌违法违纪被立案调查期间：

   • 一般原则：根据相关规定，事业单位工作人员涉嫌违法违纪，已被立案调查，不宜继续履行职责的，可以按照干部人事管理权限，经单位或者有关部门决定后，暂停其履行职务。在暂停履行职务期间，工资待遇可能会受到影响，但并非一律停发。
   • 具体处理：若调查期间未被采取强制措施（如刑事拘留、逮捕等），且未被停职的，一般应正常发放工资；若被停职调查，且调查期间未发现违法违纪行为的，停职期间应补发工资；若调查期间发现违法违纪行为，但尚未作出处分决定的，工资待遇可能根据具体情况进行调整，如停发部分或全部工资、津贴等。

2. 作为犯罪嫌疑人被刑事拘留或逮捕期间：

   • 工资停发：根据《关于事业单位工作人员和机关工人被采取刑事强制措施和受刑事处罚实行处分期间工资处理办法的通知》等相关规定，事业单位工作人员被刑事拘留或逮捕期间，一般应停发工资待遇。
   • 后续处理：若经审查后未构成犯罪或免予刑事处罚的，应补发其被刑事拘留或逮捕期间的工资；若被判处有期徒刑以上刑罚的，则根据刑罚执行情况及处分决定，确定其工资待遇的恢复或调整。

3. 作为被告或被申请人涉及民事、行政诉讼期间：

   • 工资一般不受影响：除非因诉讼导致无法正常履行职务且被停职，否则事业单位工作人员作为被告或被申请人涉及民事、行政诉讼期间，其工资待遇一般不受影响，应正常发放。
   • 特殊情况：若因诉讼导致单位对其作出停职处理，且停职期间未发现其存在过错或违法行为的，停职期间应补发工资。

法律建议：

• 保留证据：事业人员在立案期间应保留好与工资待遇相关的所有证据，如工资条、银行流水、停职通知等，以便在后续处理中维护自己的合法权益。
• 及时沟通：若对工资待遇的处理存在疑问或不满，应及时与单位人事部门或上级主管部门沟通，了解具体情况及处理依据。
• 寻求法律援助：若认为单位的处理决定侵犯了自己的合法权益，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利及维权途径。

可能后果：

• 若单位处理不当：如无故停发工资、未按规定补发工资等，事业人员有权向单位或上级主管部门提出申诉，要求纠正不当处理决定并补发工资。
• 若事业人员存在过错：如因违法违纪行为导致被停职或刑事处罚的，其工资待遇将根据相关规定进行调整或停发，且可能面临纪律处分或刑事处罚。