您好，关于借款合同的计税依据，这确实是一个涉及多个法律知识点的复杂问题，但我会尽量为您解释得清晰、详细。

首先，我们需要明确的是，借款合同的印花税计税依据主要是合同所列的借款金额。这一规定来源于《中华人民共和国印花税法》及其相关政策。具体来说，当您与银行业金融机构或经国务院银行业监督管理机构批准设立的其他金融机构签订借款合同时（不包括同业拆借），合同上明确列出的借款金额就是您需要缴纳印花税的计税依据。这里要注意的是，计税依据并不包括合同中列明的增值税税款。

举个例子，如果您的借款合同中明确借款金额为100万元，增值税税款为6万元，那么您只需要就100万元这个金额来计算印花税，增值税税款部分是不需要计入计税依据的。

对于未列明金额的应税合同，或者虽然列明了金额但后续实际结算金额与合同金额不一致的情况，计税依据会按照实际结算的金额来确定。如果实际结算金额也无法确定，那么就会按照书立合同时的市场价格或者政府定价、指导价来确定计税依据。

在税率方面，根据《中华人民共和国印花税法》及后续相关政策，借款合同的印花税税率有明确规定，但具体税率可能会因政策调整而有所变化。因此，在计算印花税时，您务必确认适用的税率是符合当前法律法规的。

此外，借款合同的纳税义务人是立合同人，也就是借款人和贷款人。双方都需要在合同签订后，按照规定的税率和计税依据，及时向税务机关申报并缴纳印花税。

当然，也存在一些免税的特殊情况。比如，与非金融机构的借款合同、企业与个人之间的借款合同等，在某些条件下可能享受免税政策。但具体是否免税，还需要参照具体的税收法规和政策来确定。

最后，我想提醒您的是，税收政策是动态变化的，您在实际操作中应密切关注相关税收政策的更新，以确保自己的纳税行为符合最新的税收要求，并合理利用免税政策减轻税负。

希望以上解释能够帮助您更好地理解借款合同的计税依据问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。