虚假发票最怕的三个证据主要包括：发票本身的真实性证明、资金流向的证据以及交易真实性的佐证材料。以下是对这三个方面的详细解释：
发票本身的真实性证明：
- 虚假发票往往存在票面信息不真实、印章不清晰或伪造、发票号码与开票单位不符等问题。税务机关或司法机关在查证时，会首先核对发票的真实性，包括通过税务系统查询发票的真伪、比对发票的印章与开票单位的备案印章是否一致等。
- 法律后果：如果发票被证实为虚假，那么开具虚假发票的行为将可能构成违法，甚至犯罪，如虚开发票罪等。根据《中华人民共和国发票管理办法》等相关规定，虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
资金流向的证据：
- 虚假发票往往伴随着虚假的资金流向，即开票方与受票方之间并没有真实的资金交易，或者资金交易与发票内容不符。税务机关或司法机关在查证时，会通过银行流水、转账记录等资金流向证据来核实交易的真实性。
- 法律后果：如果资金流向与发票内容不符，或者存在虚构资金交易的情况，那么这将作为认定虚假发票的重要证据。同时，涉及虚假资金流向的行为也可能构成其他违法犯罪，如洗钱罪等。
交易真实性的佐证材料：
- 除了发票和资金流向外，交易真实性的佐证材料也是查证虚假发票的关键。这些材料可能包括合同、协议、物流单据、出入库记录等，能够证明交易双方确实存在真实的业务往来。
- 法律后果：如果无法提供交易真实性的佐证材料，或者提供的材料与发票内容不符，那么这将进一步支持虚假发票的认定。同时，缺乏交易真实性佐证材料也可能导致税务机关对交易的真实性产生怀疑，进而对受票方进行税务稽查或处罚。
综合建议：
- 对于企业而言，应严格遵守发票管理规定，确保开具和取得的发票真实、合法、有效。同时，应建立完善的内部控制制度，加强对发票的审核和管理，防止虚假发票的流入和使用。
- 对于个人而言，在取得发票时，应仔细核对发票的真实性和合法性，避免取得虚假发票。如果发现虚假发票，应及时向税务机关举报，以维护自身的合法权益和税收秩序。
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