结论：被“旷一扣三”（即旷工一天扣三天工资）的做法是否合法，需结合具体情况判断，若公司规章制度或劳动合同中明确约定了该处罚方式，且该制度经过民主程序制定、内容合法合理，则可能被认定为合法；但若制度制定程序不合法、内容不合理或未明确告知劳动者，则可能被认定为违法，劳动者有权要求公司补发被扣工资或通过法律途径维权。以下从不同角度详细分析：
一、公司规章制度或劳动合同的约定是关键
合法有效的规章制度或劳动合同：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 若公司规章制度或劳动合同中明确约定了“旷一扣三”的处罚方式，且该制度经过上述民主程序制定，内容合法合理（如旷工行为确实给公司造成了较大损失，且扣罚比例在合理范围内），则该制度可能被认定为合法有效。
未经过民主程序或内容不合法的制度：
- 若公司规章制度或劳动合同中未明确约定“旷一扣三”的处罚方式，或者该制度未经过民主程序制定，或者内容违法（如扣罚比例过高，明显超出劳动者旷工给公司造成的损失），则该制度可能被认定为无效。
- 在此情况下，公司以“旷一扣三”为由扣罚劳动者工资，可能构成违法克扣工资，劳动者有权要求公司补发被扣工资。
二、旷工行为的性质与后果
旷工行为的定义：
- 旷工是指劳动者无正当理由未到岗工作或未履行请假手续而擅自离岗的行为。
旷工行为的后果：
- 旷工行为违反了劳动纪律和职业道德，公司有权根据规章制度或劳动合同对劳动者进行处罚。
- 但处罚方式应当合法合理，不能过度侵害劳动者的合法权益。如“旷一扣三”的处罚方式，若扣罚比例过高，可能被视为过度处罚。
三、劳动者的维权途径
与公司协商：
- 劳动者可以先与公司协商，要求公司说明扣罚工资的依据和理由，并要求公司补发被扣工资。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门介入调查并处理。
申请劳动仲裁：
- 若劳动监察部门处理无果或劳动者对处理结果不满意，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求裁决公司补发被扣工资并承担相应法律责任。
四、具体案例与法律分析
- 案例一：某公司规章制度中明确约定了“旷一扣三”的处罚方式，且该制度经过民主程序制定、内容合法合理。劳动者旷工一天后，公司按照制度扣罚了三天工资。在此情况下，该处罚方式可能被认定为合法有效。
- 案例二：某公司规章制度中未明确约定“旷一扣三”的处罚方式，或者该制度未经过民主程序制定、内容违法。劳动者旷工一天后，公司擅自按照“旷一扣三”的标准扣罚了工资。在此情况下，该处罚方式可能被认定为违法克扣工资，劳动者有权要求公司补发被扣工资。
建议：若你遇到了被“旷一扣三”的情况，建议先查看公司规章制度或劳动合同中是否有相关约定，并了解该制度的制定程序和内容是否合法合理。若认为公司的处罚方式违法或不合理，可以与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。