针对您提出的“公司证明不了私盖公章怎么办”的问题，这确实是一个涉及企业印章管理和法律责任的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答和建议：
首先，我们需要明确的是，“加盖真公章”并不等同于“合同必然有效”。即使公章是真实的，但如果盖章人员没有代表权或代理权，那么该合同可能对公司不发生效力。同样地，“加盖假公章”也不一定意味着“合同必然无效”，如果法定代表人或有代理权的人私刻假章或使用非备案章签约，并且有证据证明盖章者有权代表公司，那么合同依然可能有效。
针对您的情况，如果公司无法证明公章是被私盖的，以下是一些建议步骤：
立即报案：
- 公司应尽快向公安机关报案，说明公章可能被私盖的情况。
- 提供相关证据材料，如涉嫌私盖的公章样本、使用公章的文件等，以便公安机关进行初步审查。
配合公安机关调查：
- 公安机关在接到报案后，会展开调查，收集与案件相关的所有证据。
- 公司应积极配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和信息。
委托专业鉴定：
- 公安机关可能会委托专业的鉴定机构对涉嫌私盖的公章进行鉴定。
- 鉴定内容通常包括公章的真伪、制作方法、使用痕迹等，以确保证据的真实性和合法性。
审查内部管理：
- 公司应借此机会审查自身的印章管理制度，查找可能存在的漏洞和不足。
- 加强印章的使用和保管，确保只有授权人员才能接触和使用公章。
法律途径解决：
- 如果私盖公章的行为给公司造成了损失，公司可以考虑通过法律途径追究相关人员的责任。
- 根据鉴定结果和公安机关的调查结论，公司可以决定是否提起民事诉讼或刑事诉讼。
预防措施：
- 为了避免类似情况再次发生，公司应建立健全的印章管理制度，明确印章的使用范围和审批流程。
- 定期对印章进行盘点和检查，确保印章的安全和完整。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此上述建议仅供参考。在处理此类问题时，公司应咨询专业的法律人士或律师，以便根据具体情况制定合适的解决方案。希望这些建议能对您有所帮助。