非法行医的认定主要由卫生健康行政部门（卫健委）负责初步调查与认定，若涉嫌犯罪，则由公安机关进一步立案侦查，最终由人民法院进行司法判定。以下是对这一过程的详细解释：
卫生健康行政部门的初步认定：
- 职责：卫生健康行政部门是非法行医查处工作的主导力量，负责医疗卫生活动的日常监督管理。当接到举报或发现非法行医线索时，卫生健康行政部门会进行现场检查，收集病历、药品器械、诊疗记录等证据材料，对涉嫌非法行医的行为进行调查取证。
- 流程：卫生健康行政部门会对收集到的证据进行仔细分析和审查，以确定是否存在未取得《医疗机构执业许可证》擅自开展诊疗活动，或虽取得执业许可但超范围行医等非法行为。根据调查和证据分析结果，卫生健康行政部门会作出是否构成非法行医的初步结论，并出具相关认定意见。
公安机关的立案侦查：
- 职责：当卫生行政部门发现非法行医行为涉嫌犯罪，达到刑事立案标准时，会将案件移送公安机关。公安机关负责非法行医犯罪案件的立案侦查，进一步查明犯罪事实、收集证据。
- 流程：公安机关会运用侦查手段，如询问犯罪嫌疑人、证人，查封、扣押相关物品等，全面调查非法行医的时间跨度、涉及患者人数、造成的危害后果等关键证据。侦查终结后，公安机关会将案件移送人民检察院审查起诉。
人民法院的司法判定：
- 职责：人民法院是最终认定非法行医罪的司法机关，负责审理案件并作出判决。
- 流程：在案件经过公安机关侦查、人民检察院审查起诉后，法院会对案件进行审理。法院会严格审查控辩双方提交的证据，听取双方的辩论意见，依据法律规定和证据情况，对被告人的行为是否构成非法行医罪进行判定，并根据犯罪的事实、性质、情节和对社会的危害程度，依法判处相应刑罚。
额外说明与建议：
- 中医药管理部门的角色：在中医药领域，中医药管理部门也发挥着重要作用。对于未按规定取得中医类别医师资格或超出注册范围从事中医诊疗活动的行为，中医药管理部门将依据相关法律法规进行严格监管和惩处。
- 市场监督管理部门的配合：市场监督管理部门负责药品和医疗器械的质量监管，对非法行医中涉及的销售、使用假药、劣药或不合格医疗器械的行为进行查处，同时监督非法行医者的经营行为，打击不正当竞争和虚假宣传等违法行为。
- 公众参与与举报：如果您发现身边存在非法行医的情况，请及时向当地的卫生健康行政部门（卫健委）或相关执法部门举报。您的举报是对医疗市场秩序的有力维护，也是对自己和他人健康的负责表现。
非法行医行为严重扰乱医疗秩序，危害公众健康。如果您对非法行医问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律意见和帮助。