有案件的公司是否可以变更法人，需根据案件性质及具体情况来判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律原则与规定

1. 无明确禁止性规定：我国《公司法》并未明确禁止在公司涉及案件（无论是刑事案件还是民事案件）期间进行法定代表人的变更。变更法人属于公司内部治理事项，原则上应遵循《公司法》及公司章程规定的程序进行。

2. 合法合规性原则：尽管法律未明确禁止，但变更行为必须确保合法合规，不得影响案件的处理，也不得损害债权人或其他相关方的合法权益。

二、具体情形分析

1. 公司作为犯罪主体（刑事案件）：

   • 若公司本身作为犯罪主体被追究刑事责任（如单位犯罪），则变更法定代表人的请求通常不会被允许。因为这与刑事诉讼活动存在直接关联，相关机关会对公司的经营活动及法定代表人职责进行调查和审查。

2. 个别员工或管理层涉嫌犯罪（刑事案件）：

   • 若仅是公司个别员工或管理层涉嫌犯罪，而公司本身并未被卷入刑事案件中，理论上可以考虑变更法定代表人。但需遵循公司内部决策程序的合规性，并获得相关监管机构的批准（如司法机关无特别限制）。同时，新的法定代表人需满足资格条件，并承担相应责任和义务。

3. 公司涉及民事案件：

   • 在民事案件中，公司同样可以变更法人，但需注意相关法律规定和程序要求。例如，需履行内部决策程序、向登记机关申请变更登记、通知相关方等。此外，若公司为逃避法律责任而恶意变更法人，可能面临法律风险，如被追究原法人的责任或受到行政处罚。

4. 特殊情形下的限制：

   • 失信被执行人名单中的公司：根据相关规定，被列入失信被执行人名单的企业法定代表人变更时，需经过法院审查同意。这是为了防止企业通过变更法人来规避执行措施。
   • 司法限制：在刑事案件中，司法机关可能会根据案件需要，对公司的某些行为进行限制，包括法人变更。若司法机关认为变更法人可能影响案件侦查、证据收集或损害债权人利益等，可能会要求工商部门暂停办理相关变更手续。

三、变更程序与注意事项

1. 内部决策程序：通常需要召开股东会或股东大会，经代表三分之二以上表决权的股东通过相关决议。

2. 准备法定文件：包括变更登记申请书、股东会决议、新法定代表人的身份证明等，前往工商行政管理部门办理变更登记手续。

3. 通知相关方：应及时通知与公司有业务往来的合作伙伴、债权人等，避免产生不必要的纠纷。在涉及诉讼的情况下，还需向法院提交变更法定代表人的书面说明及新的法定代表人身份信息，以确保诉讼程序的顺利进行。

4. 考虑潜在风险：变更法人可能带来逃避责任的风险、影响诉讼进程等潜在问题。因此，在决定变更前，应充分评估风险并咨询专业意见。

四、结论与建议

综上所述，有案件的公司是否可以变更法人，需根据案件性质、司法程序的要求以及公司内部治理的合规性来综合判断。在遵循法律规定和原则的前提下，应充分考虑案件处理的需要和影响，确保变更行为合法合规且不影响案件的处理。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。