结论前置：厂里组织体检后，仅因体检结果有问题而直接开除员工，通常是不合法的。但具体是否合法，还需根据体检问题的性质、劳动合同的约定以及相关法律法规的规定来综合判断。

1. 体检问题与劳动合同解除的合法性

• 一般原则：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同必须基于法定事由，如员工严重违反公司规章制度、不能胜任工作且经过培训或调岗后仍不能胜任、严重失职给公司造成重大损害等。仅因体检结果有问题，并不直接构成用人单位解除劳动合同的合法理由。

• 特殊情况：如果体检结果显示员工患有某种疾病或存在某种健康状况，且该疾病或健康状况根据法律法规或劳动合同的约定，属于不能从事某项工作或必须调岗的情形，那么用人单位在遵循法定程序（如提前通知、支付经济补偿等）的前提下，可能可以解除劳动合同或调整工作岗位。但这种情况需要具体分析，不能一概而论。

2. 体检问题与员工权益保护

• 隐私权保护：员工的体检结果属于个人隐私信息，用人单位有义务予以保密，不得随意泄露或用于非法目的。如果用人单位未经员工同意，擅自公开或利用体检结果，可能构成侵犯隐私权，员工有权要求用人单位承担相应的法律责任。

• 健康权保障：如果体检结果显示员工存在健康问题，用人单位应当根据员工的实际情况，提供必要的帮助和支持，如调整工作岗位、安排休息或治疗等，以保障员工的健康权。

3. 实际操作建议

• 对于员工：如果因体检结果被用人单位威胁或实际解除劳动合同，员工应当及时收集相关证据（如体检报告、劳动合同、解除劳动合同的通知等），并向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

• 对于用人单位：在处理员工体检问题时，应当遵循法律法规的规定和劳动合同的约定，尊重员工的隐私权和健康权。如果因员工健康问题需要解除劳动合同或调整工作岗位，应当提前与员工沟通协商，并遵循法定程序进行操作。

4. 可能的法律后果

• 如果用人单位违法解除劳动合同：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，员工有权要求用人单位继续履行劳动合同或支付赔偿金（赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍）。

• 如果用人单位侵犯员工隐私权：员工有权要求用人单位停止侵害、赔礼道歉、赔偿损失等。

总结与建议：厂里组织体检后，仅因体检结果有问题而直接开除员工通常是不合法的。如果遇到此类情况，建议员工及时收集证据并寻求法律帮助。同时，用人单位在处理员工体检问题时也应当谨慎行事，遵循法律法规的规定和劳动合同的约定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。