公职人员出轨他人配偶并在单位造成不良影响的，单位通常会根据内部纪律规定和党纪政纪要求进行处理，具体处理方式需结合情节严重程度、社会影响及单位制度综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 单位内部纪律处理

根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》第四十条，公职人员存在“违背社会公序良俗，在公共场所有不当行为，造成不良影响”等行为的，单位可给予警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等政务处分。

• 情节较轻：若出轨行为未造成严重社会影响，单位可能通过批评教育、诫勉谈话、书面检查等方式处理，并记录在个人档案中，影响晋升或评优。
  
• 情节严重：若行为引发舆论关注、单位秩序混乱或配偶方投诉（如对方配偶以“破坏婚姻家庭”为由向单位施压），单位可能启动正式调查程序，依据调查结果给予降级、撤职甚至开除处分。

2. 党纪处分（如涉及党员）

若公职人员为中共党员，还需接受《中国共产党纪律处分条例》的约束。根据条例第一百三十八条，党员与他人发生不正当性关系，造成不良影响的，给予警告直至开除党籍处分。

• 关键点：党纪处分更注重“社会影响”和“道德示范作用”，即使未被配偶起诉，仅因单位内部或社会舆论压力，也可能被从重处理。

3. 民事法律风险

出轨行为本身不直接涉及民事赔偿，但若对方配偶以“离婚损害赔偿”为由起诉（需证明出轨是导致离婚的直接原因），公职人员可能需承担民事赔偿责任。不过，这一风险与单位处理无直接关联，更多影响个人财产。

4. 社会舆论与职业影响

公职人员代表国家形象，出轨行为易引发公众对“道德败坏”“滥用职权”的联想，即使单位未从重处理，社会舆论也可能迫使其辞职或调岗。此外，部分单位可能将此类行为纳入“师德师风”“医德医风”等专项考核，进一步限制职业发展。

建议：

1. 主动认错：若行为已被单位知晓，建议第一时间向单位承认错误，表达悔改意愿，争取从轻处理。
   
2. 配合调查：若单位启动正式调查，需如实说明情况，避免隐瞒或撒谎导致处分加重。
   
3. 法律咨询：若涉及对方配偶起诉或单位处分争议，可进一步向我咨询具体应对策略（如证据固定、申诉程序等）。
   

公职人员需时刻谨记身份约束，道德瑕疵可能成为职业生涯的“致命伤”，建议谨慎处理个人情感问题。