商标注册被驳回后，所交纳的规费通常是不予退还的，但代理费用能否退还则取决于与代理机构签订的合同约定。以下是对这一问题的详细分析：

一、商标局收费不予退还的原因

1. 成本投入：商标局在收到商标注册申请后，会进行一系列法定程序，包括形式审查、实质审查等环节。这些环节都需要投入大量的人力、物力和时间成本。因此，无论商标注册最终是否成功，商标局都已经履行了其职责，并产生了相应的成本。
2. 法律规定：根据我国《商标法》的相关规定，商标注册申请被驳回时，交纳的规费（如目前国内商标注册的官费为300元/类别，限定本类10个商品/服务项目，每超过1个另加收30元）是不会退回的。

二、代理费用能否退还的情况

1. 合同有约定：如果申请人是通过商标代理机构来办理商标注册的，且代理合同中明确规定了申请被驳回时代理机构会退还部分或全部代理费，那么代理机构应按约执行退款。
2. 合同无约定：如果合同中没有此类约定，由于代理机构已经为商标申请做了前期的准备、提交等相关工作，他们通常不会退还代理费。

三、商标注册被驳回后的应对措施

1. 了解驳回原因：首先应仔细阅读商标局发出的驳回通知书，明确具体的驳回原因，如违反商标法的禁止性规定、与在先权利冲突、商标缺乏显著性等。
2. 提出复审申请：如对驳回理由有异议，可在收到驳回通知书之日起十五天内向商标评审委员会提出复审申请。复审时需提供充分的证据和理由，以证明商标的合法性和可注册性。
3. 考虑修改商标：若商标被驳回是因缺乏显著性或与现有商标近似，可对商标进行修改，调整其文字、图形、颜色等元素，增强显著性和区分度，并重新提交注册申请。
4. 调整商品或服务范围：如商标被驳回是因商品或服务范围不明确或过于宽泛，可考虑放弃部分商品或服务，缩小范围以提高注册成功率。
5. 重新申请：若上述方式均无法解决问题，可考虑重新申请。由于商标审查涉及审查员的主观判断，重新申请可能遇到不同的审查结果。
6. 提起诉讼：如复审请求未获支持，申请人仍可在规定时间内向法院提起诉讼，通过司法途径维护自身权益。

四、建议与注意事项

• 在委托商标代理机构时，务必仔细阅读服务合同条款，特别是关于费用处理和后续服务的约定，以避免不必要的纠纷。
• 商标注册被驳回后，应及时采取措施，密切关注商标局的通知和裁定，确保操作的合法性和有效性。
• 如有需要，可以寻求专业的知识产权律师的帮助，以获得更专业的指导和支持。

综上所述，商标注册被驳回后，费用处理需根据具体情况而定，而后续应对措施则应根据驳回原因和实际情况来灵活选择。在整个过程中，保持冷静、理性应对是关键。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。