结论前置：建筑工程中的违章建筑会面临多种处罚措施，具体处罚依据违章建筑的性质、影响及所在区域的规划要求而定，包括责令停止建设、限期改正、罚款、拆除、没收实物或违法收入等，并可能承担民事赔偿责任。以下是对这些处罚措施的详细分析：

一、城镇规划区内的违章建筑处罚

1. 尚可采取改正措施消除对规划实施影响的

   • 处罚方式：由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设，限期改正，并处以建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款。
   • 举例：若某开发商在建设过程中未经批准擅自增加了建筑层数，但整改后能符合规划要求，那么该开发商将面临上述处罚。

2. 无法采取改正措施消除影响的

   • 处罚方式：限期拆除，若不能拆除，则没收实物或者违法收入，并可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
   • 举例：若在城市公园内违法建设了永久性建筑，且该建筑严重影响整体规划，无法通过改正消除影响，那么该建筑将面临限期拆除的处罚。

二、乡、村庄规划区内的违章建筑处罚

• 处罚方式：在乡、村庄规划区内，未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。
• 举例：若村民在自家宅基地外未经许可建设了附属用房，经乡镇政府责令限期改正后仍不改正，那么该附属用房将面临拆除处罚。

三、违反土地管理相关规定的违章建筑处罚

1. 违反土地利用总体规划

   • 处罚方式：限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
   • 举例：若某企业未经批准将农用耕地用于建设厂房，且该地块不符合土地利用总体规划，那么该企业将面临拆除新建厂房、恢复耕地原状的处罚。

2. 符合土地利用总体规划

   • 处罚方式：没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并可以并处罚款；同时，对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   • 举例：若某村集体未经批准占用集体土地建设办公楼，但该地块符合土地利用总体规划，那么相关部门会没收新建的办公楼，并可能对村委会相关负责人给予处分。

四、其他可能的处罚

1. 查封施工现场与强制拆除：若当事人不遵守城乡规划主管部门的停止建设或限期拆除决定，县级以上地方政府可责成相关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施。
2. 民事赔偿责任：违章建筑若侵犯相邻方的通风、采光、通行等权利，受损方有权要求建设者或所有者承担赔偿责任，如赔偿因采光不足导致的电费增加等损失。

五、处罚程序

对违章建筑的处罚必须遵循法定程序，主要包括以下环节：

• 立案：行政机关发现违法行为后，进行立案调查。
• 调查取证：收集证据，查明事实。
• 作出处罚决定：根据调查结果，依法作出处罚决定。
• 送达处罚决定书：将处罚决定书送达当事人，告知其处罚内容、理由及依据。
• 执行：按照处罚决定执行相应措施，如限期改正、罚款、拆除等。

在作出处罚决定前，行政机关应当告知当事人享有陈述和申辩的权利，确保处罚的公正性和合法性。

建议：作为建设单位或个人，应严格遵守相关法律法规，避免产生违章建筑，以免面临不必要的法律后果和经济损失。若遇到相关法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。