针对您提出的“再次入职是否可以约定试用期”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条第二款的规定：“同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。”这一条款是明确且具有法律效力的，它限制了同一用人单位对同一劳动者多次约定试用期的行为。

接下来，我们分析您提到的具体情况：员工从本公司A岗位离职5年后，再次入职本公司B岗位，且两个岗位的职责和层级完全不同。尽管岗位发生了变化，但根据《劳动合同法》的上述规定，同一用人单位与同一劳动者之间的试用期约定仍然受到限制，即只能约定一次。

您还提到了《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》和《关于中华人民共和国劳动法若干条文的说明》中的相关内容，这些文件在某些情况下可能提到了针对不同岗位可以重新约定试用期的观点。然而，当这些文件的内容与《劳动合同法》不一致时，我们应当以《劳动合同法》为准。这是因为《劳动合同法》是更高级别的法律文件，具有更高的法律效力。

此外，从实践的角度来看，试用期的主要目的是让用人单位和劳动者相互了解、双向选择。如果员工已经在本公司工作过，即使岗位发生了变化，用人单位对员工的工作能力、工作态度等方面也应该有了一定的了解。因此，在这种情况下再次约定试用期可能并不必要，也不符合《劳动合同法》的立法精神。

综上所述，无论员工再次入职的岗位是否发生变化，同一用人单位与同一劳动者都只能约定一次试用期。这是由《中华人民共和国劳动合同法》明确规定的，也是我们在处理类似情况时应当遵循的法律原则。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。