发现孩子不是亲生的，法院会根据具体情况，综合考虑各方权益，作出包括解除婚姻关系、确定抚养权归属、分割财产、处理抚养费及精神损害赔偿等在内的全面判决。以下从不同角度为您详细分析：

一、婚姻关系的解除

1. 离婚诉讼的提起：如果夫妻一方发现孩子并非自己亲生，这通常被视为严重破坏夫妻信任与感情的情况，符合《中华人民共和国民法典》中“其他导致夫妻感情破裂的情形”。因此，在调解无效的情况下，法院一般会判决准予离婚。

2. 法律依据：根据《民法典》第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

二、抚养权归属与抚养费处理

1. 抚养权变更：孩子与非亲生方无血缘关系，从法律和伦理角度考虑，孩子通常会判给亲生方抚养，以更有利于孩子的成长和身份认同。若孩子达到一定年龄（通常8周岁以上），法院会尊重其真实意愿。

2. 抚养费返还：非亲生方在不知情的情况下支付的抚养费，有权要求亲生方返还。法院会根据实际支付情况判决返还相应费用。

3. 后续费用承担：离婚后，非亲生方无需再承担孩子的抚养费、教育费、医疗费等相关费用，这些应由亲生方自行承担。

三、财产分割

1. 分割原则：根据《民法典》第一千零八十七条，离婚时夫妻共同财产由双方协议处理；协议不成时，法院将根据财产具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。

2. 无过错方权益保护：在孩子非亲生的情况下，非亲生方作为无过错方，法院在分割财产时会适当多分给其一些财产，以体现保护和补偿。同时，若亲生方存在故意隐瞒等过错行为，法院可能会判决其少分甚至不分夫妻共同财产。

四、精神损害赔偿

1. 赔偿请求权：根据《民法典》第一千零九十一条，有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：（一）重婚；（二）与他人同居；（三）实施家庭暴力；（四）虐待、遗弃家庭成员；（五）有其他重大过错。孩子非亲生的情况可认定为“有其他重大过错”，非亲生方有权向亲生方请求精神损害赔偿。

2. 赔偿数额确定：法院会综合考虑过错程度、对非亲生方造成的精神伤害等因素，确定赔偿数额。

五、亲子关系的法律认定及其他后果

1. 亲子关系解除：一旦孩子被证实非亲生，法律上的亲子关系将被解除，非亲生方将不再承担对该孩子的法定抚养义务，也不再享有相关法定权利。

2. 法律责任追究：如果女方的行为构成欺诈或其他违法行为（如故意隐瞒孩子非亲生事实以获取不当利益），她可能还会面临法律责任追究。

行动建议：

• 收集证据：在提起诉讼前，应尽可能收集相关证据，如DNA鉴定报告、聊天记录、证人证言等，以支持自己的主张。
• 咨询律师：由于此类案件涉及复杂的法律关系和情感纠葛，建议您在处理过程中及时向我咨询，以便获得更具体的法律建议和帮助。
• 保护未成年人权益：在处理此类问题时，应充分考虑未成年人的权益和感受，避免对其造成不必要的伤害。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。