事业单位停职期间工资发放需根据停职原因及单位规章制度综合判断，具体分为以下情形：

1. 因违纪违法被停职调查
   根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第25条，若停职调查期间未被证实存在违纪行为，单位应全额发放工资；若调查期间发现违纪事实但尚未作出处分决定，单位可暂停发放绩效工资、津贴补贴，但基本工资（岗位工资+薪级工资）仍需发放；若最终被给予警告、记过等处分，处分期间工资按《规定》第7-8条扣减（如警告扣减20%绩效，记过扣减30%）。

2. 因单位内部管理需要停职（如岗位调整、待岗培训）
   若停职非因员工过错（如单位机构改革、岗位撤销），根据《劳动合同法》第35条及地方工资支付规定，单位应按劳动合同约定标准支付工资。若劳动合同未明确约定，可参照单位同类岗位工资或当地最低工资标准执行，但不得低于最低工资标准的80%（部分地区规定）。

3. 医疗期停职（因病或非因工负伤）
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期内单位应按工龄支付病假工资：工龄不满2年发60%基本工资，2-4年发70%，4-6年发80%，6-8年发90%，8年以上发100%，且不得低于当地最低工资标准的80%。

4. 特殊情形（如涉嫌犯罪被刑事拘留）
   若员工被依法刑事拘留或逮捕，单位可中止履行劳动合同，期间暂停发放一切工资待遇。但若最终被宣告无罪或免予刑事处罚，单位需补发停职期间工资；若被判处有期徒刑以上刑罚，单位可依法解除劳动合同。

实务建议：

• 员工应要求单位出具书面停职通知，明确停职原因、期限及工资处理方式；
  
• 若单位未依法支付工资，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
  
• 停职期间单位仍需为员工缴纳社会保险，但个人部分可能需员工自行承担。
  

如有具体案例或地方政策疑问，可进一步说明情况，我会结合细节为您分析。