企业虚开农产品收购发票是一种严重的违法行为，这种行为将受到税务机关的严厉处罚，并可能触犯刑法，同时企业还需承担可能的民事赔偿责任。以下是对此行为的详细法律分析及可能产生的后果：
一、行政责任
没收违法所得与罚款：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，企业若虚开发票，税务机关将没收其违法所得。若虚开金额在1万元以下，可并处5万元以下的罚款；若虚开金额超过1万元，则并处5万元以上50万元以下的罚款。
停止使用或收缴发票：
- 税务机关有权根据情节严重程度，责令企业限期改正，甚至收缴其发票或停止向其发售发票，以防止其继续违法。
二、刑事责任
虚开发票罪：
- 依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，虚开除增值税专用发票以外的其他发票（包括农产品收购发票），情节严重的，将处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。若情节特别严重，将处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。这里的“情节严重”通常结合虚开发票的份数、金额等因素来判断。
虚开增值税专用发票罪（若涉及）：
- 若农产品收购发票被用于虚抵增值税进项税额，企业将面临更严厉的刑事处罚。根据虚开税款数额的大小，企业可能面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；甚至十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。
单位犯罪：
- 对于单位犯罪，不仅单位本身将被判处罚金，其直接负责的主管人员和其他直接责任人员也将依据上述规定承担相应的刑事责任。
三、民事赔偿责任
- 如果因企业虚开农产品收购发票导致国家税收损失，税务机关有权要求企业补缴相应税款及滞纳金。
- 若虚开发票行为给其他第三方（如交易相对方、被误导的投资者等）造成经济损失，受损方有权通过民事诉讼要求企业承担赔偿责任。
四、其他影响
- 企业虚开农产品收购发票还可能对其声誉、经济利益乃至长期发展产生重大负面影响。例如，企业可能被列入黑名单、纳税信用级别降低、领用发票受限等，进而影响其贷款和融资能力。
综上所述，企业虚开农产品收购发票的行为是极其危险的，不仅将面临严苛的法律制裁，还可能对企业的正常运营和未来发展造成不可估量的损害。因此，企业必须严格遵守相关税收法律法规，加强内部管理，确保合规经营，以避免不必要的法律风险和经济损失。