结论：因地铁故障导致的迟到，用人单位一般不应扣工资，但具体还需结合公司规章制度、劳动合同以及实际情况来判断。

分析如下：

1. 公司规章制度与劳动合同：

   • 首先，要查看公司的规章制度以及劳动合同中是否有关于迟到扣工资的具体规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了因不可抗力（如地铁故障等公共交通问题）导致的迟到不扣工资，那么用人单位就不能扣工资。
   • 如果规章制度或劳动合同中没有明确规定，或者规定较为模糊，那么就需要根据实际情况和公平原则来判断。

2. 实际情况与公平原则：

   • 地铁故障属于公共交通问题，通常被视为不可抗力因素。在这种情况下，员工迟到并非出于个人原因，而是由于外部不可控因素导致的。
   • 从公平原则的角度出发，用人单位在考虑是否扣工资时，应充分考虑员工的实际情况和迟到原因。如果因为地铁故障等不可抗力因素导致迟到，且员工能够及时通知用人单位并说明情况，那么用人单位一般不应扣工资。

3. 法律条款参考：

   • 虽然具体的法律条款可能并未直接规定因地铁故障迟到是否扣工资，但根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位在制定规章制度时应当遵循合法、合理、公平的原则，并不得违反法律法规的强制性规定。
   • 如果用人单位的规章制度或劳动合同中的规定违反了法律法规的强制性规定，或者显失公平，那么这些规定可能是无效的。

建议：

• 如果您因地铁故障迟到而被扣工资，首先建议您查看公司的规章制度和劳动合同，了解是否有相关规定。
• 如果规章制度或劳动合同中没有明确规定，或者您认为公司的扣工资行为不合理，您可以与用人单位进行沟通协商，说明情况并寻求解决方案。
• 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

后续行动：

• 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据，如地铁故障的通知、迟到通知、工资条等，以便在需要时提供证明。
• 如果您对具体的法律条款或处理流程有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。