工程暂停令一般需要加盖发令单位的公章或者合同专用章，具体分析如下：

一、公章的使用

1. 公章的法律效力：公章是单位对外行使权力的标志，具有最高的法律效力。在工程暂停令上加盖公章，意味着该暂停令是发令单位正式发出的，具有法律约束力。

2. 公章的使用场景：通常，在涉及单位重大决策、对外合同、法律文件等正式场合，都会使用公章。工程暂停令作为对工程项目进行管理的正式文件，加盖公章是合适的。

二、合同专用章的使用

1. 合同专用章的法律效力：合同专用章是单位专门用于签订合同的印章，其法律效力与公章相当，但在使用范围上有所限制，主要用于合同签订等特定场合。

2. 合同专用章的使用场景：如果工程暂停令与合同履行、变更或解除等事项密切相关，且发令单位有使用合同专用章的习惯或规定，那么在该暂停令上加盖合同专用章也是可行的。不过，这种情况相对较少见，因为工程暂停令更多是一种管理指令，而非合同文件。

三、其他注意事项

1. 印章的真实性：无论使用公章还是合同专用章，都必须确保印章的真实性和合法性。伪造或使用非法印章将可能导致法律责任。

2. 印章的保管和使用：单位应建立健全印章管理制度，明确印章的保管、使用和审批程序。在发出工程暂停令时，应确保印章的使用符合相关规定和程序。

3. 暂停令的合法性和合理性：除了印章问题外，工程暂停令的发出还应符合相关法律法规和合同条款的规定，确保其合法性和合理性。如果暂停令的发出缺乏合法依据或不合理，可能会引发纠纷和法律责任。

建议：在实际操作中，如果对工程暂停令应加盖何种印章存在疑问，建议咨询相关单位或法律专业人士的意见，以确保暂停令的合法性和有效性。如果您在工程暂停令的发出或接收过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。