结论：在国家企业信用信息公示系统查不到的企业，并不意味着不能起诉。能否起诉主要取决于被告是否明确、是否存在有效的法律关系以及是否符合起诉条件，而非单纯取决于能否在公示系统查询到企业信息。以下从多个角度进行详细分析：
一、企业信息查询不到的可能原因
企业未注册或已注销：
- 若企业确实未在市场监督管理部门注册登记，或已办理注销登记手续，则公示系统无法查询到相关信息。
- 应对措施：核实企业名称、统一社会信用代码等关键信息，确保准确无误。若企业确实未注册或已注销，则需考虑其他法律途径或寻找其他责任主体。
系统或网络问题：
- 公示系统可能因定期维护、升级或临时故障导致无法查询。
- 应对措施：访问公示系统官方网站查看公告，了解系统运行状态；稍后再试或联系系统客服了解情况。同时，检查自身网络连接是否稳定，尝试切换网络环境或更换浏览器进行查询。
企业信息被隐藏或特殊状态：
- 企业可能因某些原因选择隐藏部分信息，或处于新设立、合并、分立、迁移等特殊状态，导致信息查询不到。
- 应对措施：通过其他途径进一步核实企业信息，如联系当地工商局或企业登记机关。对于新设立企业，可等待几个工作日后再次查询；对于合并、分立或迁移的企业，可向原登记机关或现登记机关咨询具体信息。
二、起诉的条件与准备
明确被告：
- 起诉时需明确被告的身份信息，包括企业名称、住所、法定代表人或负责人等。
- 若公示系统查询不到：可通过其他途径获取企业信息，如企业官网、行业协会、商业合作伙伴等。若确实无法获取，可考虑向法院申请调查令或委托律师进行调查。
存在有效的法律关系：
- 起诉需基于存在有效的法律关系，如合同关系、侵权关系等。
- 准备证据：收集并整理与案件相关的证据材料，如合同、发票、聊天记录、录音录像等，以证明法律关系的存在及对方的违约或侵权行为。
符合起诉条件：
- 起诉需符合《民事诉讼法》规定的起诉条件，包括原告与本案有直接利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由、属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖等。
三、实际操作建议
多途径核实企业信息：
- 除公示系统外，还可通过全国企业信用信息公示系统（地方版）、第三方企业信息查询平台、企业官网等途径核实企业信息。
咨询专业律师：
- 若对企业信息查询或起诉条件存在疑问，可咨询专业律师以获取更准确的指导和帮助。律师可协助调查企业信息、评估案件风险、准备起诉材料等。
关注案件进展与执行：
- 起诉后需关注案件进展情况，及时配合法院进行调解、庭审等工作。若判决生效后对方未履行义务，可申请强制执行以维护自身合法权益。
总结：在国家企业信用信息公示系统查不到的企业并不意味着不能起诉。关键在于能否明确被告身份、存在有效的法律关系以及符合起诉条件。若遇到查询不到企业信息的情况，可通过多途径核实企业信息、咨询专业律师并关注案件进展与执行情况来维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。