国企收购违法违章私营企业厂房的合法性不能一概而论，需分情况讨论：

1. 违法违章建筑本身的性质：

   • 违法违章建筑，通常指的是未经规划、建设等部门批准，擅自搭建的建筑物或构筑物。这类建筑在法律上是不被认可的，可能面临被拆除、罚款等行政处罚。
   • 如果私营企业的厂房本身就是违法违章建筑，那么从法律层面讲，该厂房并不具备合法的产权或使用权。国企收购这样的厂房，从产权转移的角度来说，是存在法律障碍的，因为违法违章建筑无法办理合法的产权过户手续。

2. 收购行为的合法性：

   • 收购行为本身需要遵守相关的法律法规，包括但不限于公司法、合同法、物权法等。如果收购行为违反了这些法律法规，那么该收购行为就是违法的。
   • 国企作为收购方，有义务对目标企业的资产进行尽职调查，包括厂房的产权状况、是否违法违章等。如果国企在明知厂房是违法违章建筑的情况下仍然进行收购，那么国企可能需要承担相应的法律责任。

3. 可能的法律后果：

   • 如果国企收购了违法违章的厂房，可能会面临行政处罚，如被要求拆除厂房、罚款等。
   • 在民事法律关系上，如果因厂房违法违章导致第三方受损（如相邻权受损），国企作为厂房的当前所有者或使用者，可能需要承担赔偿责任。
   • 从刑事法律关系上，如果国企在收购过程中存在欺诈、行贿等违法行为，相关责任人还可能面临刑事处罚。

4. 建议与措施：

   • 国企在收购私营企业厂房前，应进行充分的尽职调查，确保厂房的产权清晰、合法合规。
   • 如果发现厂房存在违法违章情况，国企应谨慎考虑收购的可行性，必要时可寻求法律专业人士的帮助，评估法律风险。
   • 如果国企已经收购了违法违章的厂房，应尽快与相关部门沟通，了解处理方案，如补办手续、拆除重建等，以降低法律风险。

总结来说，国企收购违法违章私营企业厂房的合法性取决于多个因素，包括厂房本身的性质、收购行为的合法性以及可能的法律后果。国企在收购前应进行充分的尽职调查，确保收购行为的合法合规，以降低法律风险。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。