在行政复议作出不予受理决定后，若选择起诉，被告的确定主要依据作出不予受理决定的行政机关，具体分析如下：
一般原则：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为行政机关和行政机关工作人员的行政行为侵犯其合法权益，有权依照本法向人民法院提起诉讼。在行政复议不予受理的情况下，通常作出不予受理决定的行政机关即为被告。这是因为该机关是直接对复议申请作出处理的主体，其不予受理的决定直接影响了申请人的权益。
特殊情况：
- 复议机关不作为：如果申请人向有管辖权的行政复议机关提出复议申请，但复议机关在法定期限内未作出任何决定（包括不予受理决定），此时申请人若选择起诉，被告应为该复议机关。但需注意，这种情况与直接作出不予受理决定有所不同，它涉及的是复议机关的不作为。不过，就本题而言，主要关注的是已作出不予受理决定的情况，所以此点更多作为背景知识提供。
- 经过复议的案件：虽然本题不直接涉及经过复议后起诉原行政行为的情况，但为全面理解，需指出：若复议机关改变了原行政行为，申请人对复议决定不服起诉的，被告为复议机关；若复议机关维持了原行政行为，申请人对原行政行为和复议决定均不服起诉的，被告为作出原行政行为的行政机关和复议机关。然而，这些情况与本题讨论的“不予受理”决定不直接相关。
实践中的注意事项：
- 在确定被告时，应仔细审查不予受理决定书上的落款单位，即作出该决定的行政机关。
- 如果不予受理决定是由某个行政机关的内部机构（如法制科、复议办公室等）作出的，但该机构并非独立承担法律责任的主体，那么被告应为该行政机关本身，而非其内部机构。
- 在起诉时，应确保被告的名称、地址等信息准确无误，以便法院能够正确送达诉讼文书并开展后续诉讼程序。
法律建议：
- 在收到不予受理决定后，若认为该决定违法或不当，应及时咨询专业律师，评估起诉的可行性和风险。
- 在准备起诉材料时，应仔细收集、整理相关证据，包括复议申请书、不予受理决定书、相关证据材料等，以支持自己的诉讼请求。
- 在起诉过程中，应积极配合法院的工作，按时提交诉讼材料、参加庭审等，以确保自己的合法权益得到有效维护。
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