关于员工迟到早退罚款（或扣工资）的合法性，这确实是一个需要细致分析的问题，因为它涉及到公司规章制度、相关法律法规以及具体实施情况等多个方面。

首先，从法律层面来看：

1. 公司罚款权力的本质：罚款在严格意义上是一种行政处罚措施，根据《行政处罚法》，只有特定的行政机关或组织才有权实施。企业作为民事主体，并不直接拥有罚款权力。但《劳动合同法》允许企业制定内部规章制度来管理员工，如果这些规章制度合法且合理，企业可以依据其对员工进行经济惩处。

2. 规章制度的合法性：企业的规章制度必须经过民主程序制定，并向员工公示或告知。规章制度中的罚款条款应明确、具体，且与员工的违纪行为相适应，不能违反法律法规的强制性规定。

其次，从合理性角度考量：

1. 管理必要性：员工迟到早退确实可能影响工作效率和团队协作，企业有必要进行管理和约束。通过制定合理的考勤制度，企业可以引导员工遵守劳动纪律。

2. 罚款的合理性：罚款数额应合理，与员工的迟到早退情节、给公司造成的损失等因素相适应。罚款不能替代正常的劳动管理措施，如批评教育、警告等，而应作为辅助手段。如果因员工迟到早退给公司造成了经济损失，公司可以要求赔偿，但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。

具体到迟到早退扣工资的情况：

• 扣工资在一定条件下是合法的，但必须符合规章制度明确、程序合法、扣罚合理等条件。规章制度应经过民主程序制定，向员工公示告知，并明确规定迟到早退的扣薪标准。
• 劳动合同中也可以约定迟到早退属于违反合同约定的行为，并规定相应的扣薪条款，但该条款需公平合理，且与规章制度相一致。
• 扣工资的额度应当合理，确保扣罚金额与员工的过错相适应。扣除的金额一般不应超出劳动者当月应得薪酬的一定比例（如20%），且扣除后的剩余工资不能低于当地最低工资标准。

如果遇到不合法的扣工资行为：

• 员工可以首先尝试与用人单位协商解决，表达异议和诉求。
• 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
• 在必要时，员工还可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。

综上所述，员工迟到早退罚款（或扣工资）的合法性取决于多个因素的综合考量。企业应确保规章制度的合法性、合理性和透明性；员工也应了解自己的权益和维权途径，并在必要时依法维护自己的合法权益。