结论：不动产登记过程中存在程序违法，即使过了公示期，您仍然可以申请行政复议。不过，具体能否成功以及后续的处理方式，还需根据具体情况来分析。
分析说明：
行政复议的申请期限：
- 一般来说，行政复议的申请期限是从知道该具体行政行为之日起六十日内提出。但这里有一个特殊情况，即如果因为不动产提起诉讼的案件，自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院不予受理。不过，这一规定主要针对的是行政诉讼，对于行政复议的申请期限，通常还是遵循六十日的规定，除非法律、法规另有规定。
- 公示期本身并不直接决定行政复议的申请期限。公示期更多是用于公示相关信息，让公众了解并有机会提出异议，但它不是行政复议申请期限的起算点或限制点。
程序违法与行政复议：
- 如果不动产登记过程中存在程序违法，比如未依法进行公告、未听取利害关系人的意见等，这构成了对法定程序的违反。
- 行政复议是公民、法人或其他组织认为行政行为侵犯其合法权益时，向行政复议机关提出申请，由行政复议机关依法对原行政行为的合法性、适当性进行审查并作出决定的一种制度。因此，对于程序违法的不动产登记行为，您完全有权申请行政复议。
过了公示期的影响：
- 过了公示期并不意味着您就失去了申请行政复议的权利。公示期主要是用于信息公示和异议提出，它并不直接决定您能否对不动产登记行为提出异议或申请行政复议。
- 关键在于您是否在知道或应当知道不动产登记行为存在程序违法之日起六十日内（或法律、法规规定的其他期限内）提出了行政复议申请。
后续行动建议：
- 收集证据：在申请行政复议前，建议您先收集好相关证据，比如不动产登记的相关文件、程序违法的具体事实等，以便在行政复议过程中有力地支持您的主张。
- 提交申请：准备好行政复议申请书及相关证据材料后，向有管辖权的行政复议机关提交申请。行政复议机关会依法对您的申请进行审查，并作出决定。
- 关注进展：在行政复议过程中，建议您保持与行政复议机关的沟通联系，及时了解案件的进展情况，并根据需要补充相关证据或材料。
特殊场景提醒：
- 如果不动产登记行为已经对您造成了实际损害，且该损害与程序违法有直接因果关系，那么在申请行政复议的同时，您还可以考虑通过法律途径追究相关责任人的民事赔偿责任。
法律条款参考：
- 《中华人民共和国行政复议法》第九条：公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请；但是法律规定的申请期限超过六十日的除外。
如果您在不动产登记行政复议过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。