员工造成公司损失时，公司可依据相关法律法规追究其赔偿责任，具体规定和操作流程如下：

一、主要法律依据及解释

1. 《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条

   • 规定内容：用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。用人单位承担侵权责任后，可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。
   • 实例说明：如公司司机在执行运输任务时，因严重超速导致交通事故，造成他人财产损失，公司在对外赔偿后，有权向该司机追偿因其故意或重大过失造成的损失部分。

2. 《中华人民共和国劳动法》第一百零二条

   • 规定内容：劳动者违反本法规定的条件解除劳动合同或者违反劳动合同中约定的保密事项，对用人单位造成经济损失的，应当依法承担赔偿责任。
   • 实例说明：员工违反竞业限制协议，到竞争对手处工作，导致原公司业务流失或商业秘密泄露，原公司有权要求该员工赔偿因此造成的经济损失。

3. 《中华人民共和国劳动合同法》相关条款

   • 第二十三条：用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
   • 第九十条：劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
   • 实例说明：员工擅自泄露公司核心技术或客户信息，导致公司遭受重大经济损失，公司有权要求该员工赔偿全部或部分损失，并可能依据合同约定要求支付违约金。

4. 《工资支付暂行规定》第十六条

   • 规定内容：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 实例说明：员工因操作失误导致公司设备损坏，公司根据设备维修费用和员工责任程度，要求员工赔偿一定金额，并可从其工资中按月扣除，但扣除比例需遵守上述规定。

二、赔偿责任的构成条件

要追究员工的赔偿责任，公司需满足以下条件：

1. 证明损失存在：公司需提供确凿证据证明实际损失的发生，如货物损毁、客户索赔等直接损失。
2. 证明因果关系：公司需证明损失与员工行为之间存在直接的因果关系，即员工的过错行为是导致损失发生的直接原因。
3. 证明主观过错：员工需存在故意或重大过失。一般过失通常被视为公司的经营风险，不要求员工赔偿。例如，员工因疏忽大意导致的小额损失，一般不视为重大过失。

三、赔偿方式与操作流程

1. 协商处理：公司可与员工就赔偿金额、方式及期限进行协商，达成一致意见。这种方式有助于维护双方关系，减少纠纷。
2. 按约定或实际损失赔偿：
   • 如劳动合同中有相关约定，公司可按约定要求赔偿。
   • 如无具体约定，公司可要求员工按实际损失数额赔偿，但需考虑员工的承受能力和经济状况。
3. 从工资中扣除：赔偿款可从员工工资中扣除，但需遵守《工资支付暂行规定》的限制，即每月扣除部分不得超过月工资的20%，且剩余工资不得低于当地最低工资标准。
4. 仲裁或诉讼：如协商不成，公司可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，公司需提供充分证据证明员工的过错行为和损失情况。

四、其他注意事项

1. 证据收集与保存：公司在处理此类问题时，应及时收集并妥善保存相关证据，如工作记录、监控录像、邮件往来等，以支持其主张。
2. 依法依规处理：公司在追究员工赔偿责任时，应严格遵守法律法规，确保自身行为的合法性和合规性。避免采取非法手段或过度惩罚员工。
3. 考虑员工承受能力：在确定赔偿金额和方式时，公司应考虑员工的经济状况和承受能力，避免给员工造成过大的经济压力。

总结：员工造成公司损失时，公司可依据相关法律法规追究其赔偿责任。在处理过程中，公司应注重证据的收集与保存，依法依规进行操作，并确保赔偿方式的合理性与合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。