在苗种生产许可证正在办理过程中而进行生产，这一行为是否违法，需分情况讨论：
若许可证最终获得批准：
- 在此情况下，虽然生产行为发生在许可证办理过程中，但鉴于最终获得了合法许可，且生产行为本身未违反其他法律法规（如环保、安全生产等），则该生产行为通常不会被认定为违法。然而，这并不意味着在办理过程中可以无视相关法规进行生产，因为办理过程中的生产仍需确保符合其他相关法规要求，且需尽快完成许可证的办理手续，以避免潜在的法律风险。
若许可证未获得批准：
- 若最终未能获得苗种生产许可证，则在此过程中进行的生产行为很可能被视为违法。因为根据相关法律法规，从事苗种生产活动必须取得相应的许可证，未取得许可证而擅自进行生产，将面临行政处罚，甚至可能构成非法经营罪等刑事犯罪，具体取决于生产规模、影响程度及是否造成严重后果等因素。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国渔业法》及相关法律法规，从事苗种生产活动必须依法取得苗种生产许可证。这是为了保障水产苗种的质量和安全，维护渔业生产秩序和生态环境。
- 法律建议：
- 在办理苗种生产许可证过程中，应严格遵守相关法律法规，不得擅自进行生产活动。
- 若因特殊情况需提前进行生产，应咨询当地渔业主管部门，了解是否可以办理临时许可或采取其他合法措施。
- 一旦许可证办理完成，应确保生产活动符合许可证规定的范围和条件，避免超范围生产或违反其他相关法规。
可能的法律后果：
- 若未经许可擅自进行苗种生产，可能面临渔业主管部门的行政处罚，如罚款、没收违法所得、责令停止生产等。
- 若生产行为造成严重后果或情节严重，还可能构成非法经营罪等刑事犯罪，面临刑事处罚。
总结与进一步思考：
- 办理苗种生产许可证是从事苗种生产活动的必要前提，务必确保在取得合法许可后再进行生产。
- 在办理过程中，应积极与渔业主管部门沟通，了解办理进度和要求，确保生产活动的合法性和合规性。
- 若对办理流程或相关法律法规有疑问，可直接向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。