当刑事拘留后发现犯罪嫌疑人是人大代表时，我们必须遵循一系列严格且特定的法律程序来处理，以确保人大代表的合法权益与司法公正得到双重保障。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与处理原则
根据《中华人民共和国全国人民代表大会和地方各级人民代表大会代表法》的相关规定，县级以上的各级人民代表大会代表，非经本级人民代表大会主席团许可，在本级人民代表大会闭会期间，非经本级人民代表大会常务委员会许可，不受逮捕或者刑事审判。若因现行犯被拘留，执行拘留的机关应立即向该级人民代表大会主席团或常务委员会报告。对于乡、民族乡、镇的人民代表大会代表，若被采取限制人身自由的措施，执行机关也需立即报告相应的人民代表大会。
处理此类案件时，我们需坚持以下原则：
- 法律平等原则：人大代表虽享有人身自由特殊法律保护权，但并非特殊公民，其违法犯罪行为同样受法律制裁。
- 程序严格原则：必须严格遵守法定程序，确保每一步都合法合规。
- 监督与公正原则：通过特殊处理流程，既保障人大代表依法履行职责，又确保司法机关的执法活动在法治轨道上进行。
二、具体处理流程
立即报告：
- 对于县级以上人大代表，如果是现行犯被拘留，执行拘留的机关应立即向该代表所属的人民代表大会主席团（会议期间）或常务委员会（闭会期间）报告。
- 对于乡、民族乡、镇的人大代表，执行拘留或采取其他限制人身自由措施的公安机关等执行机关应立即报告乡、民族乡、镇的人民代表大会。
审查与决定：
- 相关人民代表大会主席团或常务委员会在收到报告或申请许可后，将审查是否存在对代表在人民代表大会各种会议上的发言和表决进行法律追究，或者对代表提出建议、批评和意见等其他执行职务行为打击报复的情形。
- 根据审查结果，作出是否许可继续采取强制措施的决定。若认为拘留不当或影响国家权力机关正常运转，应要求执行拘留的机关立即释放。
执行程序：
- 在获得相应人民代表大会主席团或常务委员会的许可后，执行机关需按照法定的刑事诉讼程序，出示相关法律文书，对人大代表执行刑事拘留。
- 执行机关在执行刑事拘留后，应及时通知被拘留人的家属、所在单位等，并明确告知其享有的权利和救济途径。
后续处理：
- 若拘留合法且必要，则按照刑事诉讼程序继续进行侦查、审查起诉等后续工作。
- 在整个过程中，必须确保人大代表的合法权益不受侵犯，同时体现法律的公正与权威。
- 案件处理结果应及时向相应的人民代表大会主席团或者常务委员会报告。
三、特殊情况处理
- 紧急情况：如果因为是现行犯被拘留，虽然可以先执行拘留，但仍需立即向相关人民代表大会主席团或常务委员会报告，并遵循后续的审查与决定程序。
四、注意事项
- 在处理涉及人大代表的拘留案件时，必须严格遵守法定程序，确保程序的公正性、合法性和透明度。
- 人大代表的合法权益应得到充分保障，包括辩护权、申诉权等各项诉讼权利。
- 如需对人大代表进行进一步的法律处理，也应严格按照相关法律规定进行。
综上所述，当刑事拘留后发现犯罪嫌疑人是人大代表时，我们应依法、及时、严格地按照相关程序进行处理，以确保法律的公正、权威与人大代表的合法权益得到充分保障。