违规加层通常需要承担行政责任，情节严重或造成严重后果的还可能涉及刑事责任，同时可能面临民事赔偿问题。具体处理方式需结合加层行为的性质、后果及法律规定综合判断，以下分情况说明：

一、行政责任层面

1. 责令限期改正
   根据《城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或未按许可加层的，由城乡规划主管部门责令停止建设，限期拆除或改正。若加层部分符合规划要求，可能需补办手续并缴纳罚款（罚款标准通常为工程造价的5%-10%）。

2. 强制拆除
   若加层行为严重影响城市规划或无法采取改正措施，主管部门可强制拆除违法建筑，拆除费用由违法者承担。例如，加层导致楼体结构安全隐患或占用公共空间时，通常会被要求拆除。

3. 行政处罚
   除拆除外，还可能面临罚款、没收违法所得等处罚。例如，若加层用于出租或经营，可能被没收违法收入，并处以更高额度的罚款。

二、刑事责任层面

1. 工程重大安全事故罪
   若加层由无资质单位施工，且导致建筑物倒塌、人员伤亡等严重后果，直接责任人员可能触犯《刑法》第一百三十七条，面临五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

2. 以危险方法危害公共安全罪
   若加层行为明知存在重大安全隐患仍故意实施，且足以危害不特定多数人生命安全，可能构成此罪，最高可处死刑（需结合具体情节判断）。

三、民事责任层面

1. 对相邻权人的赔偿
   若加层导致邻居采光、通风受阻或房屋结构受损，需根据《民法典》第二百八十八条承担侵权责任，包括停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。

2. 合同违约责任
   若加层涉及租赁、装修等合同关系，可能因违反合同约定（如擅自改变房屋结构）需向对方支付违约金或赔偿损失。

四、处理建议

1. 立即停止施工
   若正在加层，应第一时间停工，避免损失扩大或引发更严重法律后果。

2. 主动申报整改
   向当地城乡规划部门说明情况，申请补办手续或自行拆除违法部分，争取从轻处理。

3. 委托专业机构评估
   若加层已建成，可委托结构安全鉴定机构出具报告，证明无安全隐患，为后续协商或诉讼提供依据。

4. 协商或诉讼解决纠纷
   若与相邻权人或合同相对方产生争议，可优先协商；协商不成，可通过诉讼或仲裁解决。

提示：违规加层的法律后果复杂，需结合具体情节判断。若有进一步疑问或需具体方案，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细建议。