公安机关在询问证人时，确实需要在笔录中注明证人的权利义务。以下是对这一问题的详细分析：

法律依据与程序要求

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释的规定，公安机关在询问证人时，应当告知其有权如实提供证据、证言，并有权拒绝与本案无关的问题，同时也有义务如实提供证据、证言，不得伪造、隐匿或者毁灭证据。这些权利义务的告知，是保障证人合法权益、确保证言真实性和合法性的重要环节。因此，在制作询问证人的笔录时，公安机关应当明确记录证人的权利义务告知情况。

笔录内容的具体要求

1. 权利告知：笔录中应详细记录公安机关向证人告知的权利内容，包括但不限于如实提供证据、证言的权利，拒绝与本案无关问题的权利，以及在受到威胁或侵害时寻求法律保护的权利等。

2. 义务告知：同样，笔录中也应明确记录证人需要承担的义务，如如实提供证据、证言的义务，不得伪造、隐匿或者毁灭证据的义务，以及保守案件秘密的义务等。

3. 告知确认：为了确保证人已经充分理解并知晓其权利义务，公安机关还应在笔录中记录证人对权利义务告知的确认情况，如证人是否表示已经理解并同意遵守相关权利义务等。

实践中的注意事项

1. 全面记录：公安机关在制作询问证人的笔录时，应确保记录内容全面、准确，不得遗漏或歪曲证人的陈述和权利义务告知情况。

2. 证人签字确认：笔录制作完成后，应由证人仔细阅读并签字确认。证人签字确认是笔录具有法律效力的重要环节，也是保障证人权益的重要措施。

3. 法律后果：如果公安机关在询问证人时未依法告知其权利义务，或者笔录记录不全面、不准确，可能会影响证言的合法性和有效性，甚至可能导致相关证据被排除在法庭审理之外。

特殊情况的处理

在特殊情况下，如证人因年幼、精神疾病等原因无法理解或表达其权利义务时，公安机关应采取适当措施确保其权益得到保障，并在笔录中详细记录相关情况。例如，可以邀请法定代理人或专业人士在场协助询问，并在笔录中记录他们的意见和见证情况。

综上所述，公安机关在询问证人时，必须在笔录中注明证人的权利义务。这是保障证人合法权益、确保证言真实性和合法性的重要环节。如果您在相关方面遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。