是的，首选鉴定机构无法进行鉴定时，可以由备选鉴定机构进行鉴定。以下从不同角度为您详细分析：
法律背景与依据
在合同纠纷中，当需要对某些专业问题进行鉴定时，通常会事先约定首选鉴定机构和备选鉴定机构。这种约定旨在确保鉴定的专业性和公正性，同时也为可能出现的首选鉴定机构无法鉴定的情况提供了解决方案。虽然直接的法律法规可能并未明确提及“首选”和“备选”鉴定机构的具体操作，但根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释中关于鉴定的规定，可以合理推断，在首选鉴定机构无法履行鉴定职责时，备选鉴定机构作为替代方案是合法且合理的。
实际操作中的考虑
合同约定：首先，应查看合同中是否有关于鉴定机构选择的具体条款。如果合同明确规定了首选和备选鉴定机构，以及首选鉴定机构无法鉴定时的处理方式，那么应严格按照合同约定执行。
双方协商：如果合同中没有明确规定，或者规定不够明确，双方可以协商选择备选鉴定机构。在协商过程中，应确保备选鉴定机构具备相应的资质和经验，以保证鉴定的准确性和公正性。
法院或仲裁机构指定：如果双方无法就备选鉴定机构达成一致，或者合同中没有相关规定，且争议涉及诉讼或仲裁，那么可以由法院或仲裁机构根据相关规定和实际情况指定鉴定机构。
可能的法律后果
鉴定结果的有效性：无论是由首选鉴定机构还是备选鉴定机构进行的鉴定，只要鉴定机构具备相应的资质和经验，且鉴定过程符合法律规定和程序要求，其鉴定结果通常都是有效的，可以作为认定案件事实的依据。
鉴定费用的承担：鉴定费用的承担通常根据合同约定或法律规定来确定。如果合同中有明确规定，则按照合同约定执行；如果合同中没有规定，则可能需要根据双方的责任大小、过错程度等因素来综合判断。
建议与注意事项
提前规划：在签订合同时，应充分考虑可能出现的鉴定需求，并明确约定首选和备选鉴定机构以及相关处理方式，以避免后续争议。
选择有资质的鉴定机构：在选择鉴定机构时，应确保其具备相应的资质和经验，以保证鉴定的准确性和公正性。
保留相关证据：在鉴定过程中，应保留好与鉴定相关的所有证据和资料，以备后续需要。
如果您在合同纠纷中遇到了首选鉴定机构无法鉴定的情况，并需要选择备选鉴定机构进行鉴定，或者有任何其他法律问题，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律建议和解决方案。