结论：新商标法生效后，原有公司注册的大量商标并不会被强行注销，但可能会受到新法某些条款的影响或面临特定的审查要求。以下是对此问题的详细分析：
商标法的稳定性与连续性：
- 商标法作为保护商标权人权益、维护市场秩序的重要法律，其修改通常旨在更好地适应社会经济发展和市场需求，而非对过去已注册的商标进行大规模清理或注销。
- 新商标法的生效，并不意味着原有已注册的商标自动失效或需要被注销。除非新法明确规定了某些特定情形下的商标注销或撤销程序，否则原有商标继续有效。
新商标法可能带来的影响：
- 审查标准的变化：新商标法可能对商标的注册条件、审查标准等进行了调整。这可能导致原有公司在未来申请新商标时面临更严格的审查，但并不影响其已注册商标的效力。
- 使用与管理要求：新法可能增加了对商标使用、管理等方面的要求，如要求商标权人定期提交使用证明、加强商标保护意识等。原有公司需遵守这些新要求，以确保其商标的持续有效。
- 特定情形的注销或撤销：如果新商标法明确规定了某些特定情形下的商标注销或撤销程序（如连续三年未使用、恶意抢注等），且原有公司的商标符合这些情形，那么这些商标可能会面临被注销或撤销的风险。但这种情况并非普遍适用，而是针对特定情形的个别处理。
原有公司的应对策略：
- 了解新法内容：原有公司应仔细研读新商标法的相关规定，了解其对商标注册、使用、管理等方面的新要求。
- 加强商标管理：建立健全商标管理制度，确保商标的合法使用和有效保护。定期对已注册商标进行审查和维护，及时处理可能存在的问题。
- 积极应对审查：如果面临商标审查或争议处理，原有公司应积极配合相关部门的工作，提供必要的证据和材料，以维护其商标的合法权益。
建议：原有公司无需过分担心新商标法生效后其已注册商标会被强行注销的问题。但应密切关注新法的实施动态和相关政策变化，及时调整其商标管理策略以适应新法的要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。