结论概述：员工对公司制度不合理提出的建议，其签字是否有效，需根据具体情况判断，包括建议的内容、形式以及公司的接受程度等。一般来说，单纯的建议签字并不直接产生法律效力，但可能作为公司改进制度的参考或证据。

详细分析：

1. 建议的性质与效力：

   • 建议本身：员工对公司制度提出的建议，本质上是一种意见表达或改进提议。它并不直接构成法律上的合同或协议，因此，单纯的建议签字并不直接产生法律效力。
   • 法律效力：要使建议产生法律效力，通常需要将其转化为具有法律约束力的文件，如合同、协议或规章制度等，并经过双方（员工与公司）的协商一致和正式签署。

2. 建议的形式与内容：

   • 形式要求：建议的形式可以是书面的，也可以是口头的。但书面建议，尤其是员工签字的书面建议，更具有证据力和说服力，有助于公司了解员工的真实想法和需求。
   • 内容要求：建议的内容应当具体、明确，指出公司制度中存在的问题或不合理之处，并提出具体的改进建议。这样的建议更容易被公司接受和采纳。

3. 公司的接受与回应：

   • 接受建议：如果公司认为员工的建议合理且可行，可能会采纳并修改相关制度。此时，员工的建议虽然不直接产生法律效力，但对公司制度的改进起到了积极作用。
   • 不接受建议：如果公司认为员工的建议不合理或不可行，可能会拒绝采纳。此时，员工的建议签字更多是一种意见表达，不会对公司产生法律约束力。

4. 建议作为证据的可能性：

   • 劳动争议：在劳动争议中，如果员工认为公司制度侵犯了其合法权益，并提出了书面建议但未被采纳，该建议签字可能作为员工主张权利的证据之一。但具体能否作为有效证据，还需根据争议的具体情况和相关法律法规进行判断。
   • 其他法律纠纷：在其他涉及公司制度的法律纠纷中，员工的建议签字也可能作为相关事实的证据之一，但同样需要具体分析其证明力和关联性。

法律建议：

• 明确建议目的：员工在提出建议时，应明确其目的和期望达到的效果，以便公司更好地理解和评估建议的可行性。
• 保留书面证据：建议员工以书面形式提出建议，并保留好相关证据（如签字确认的书面建议、邮件往来等），以备不时之需。
• 寻求法律支持：如果员工认为公司制度存在严重问题且侵犯了其合法权益，可以寻求法律支持或咨询专业律师，了解自己的权利和义务以及可能的法律途径。

后续行动建议：

• 如果您对公司制度有具体的不合理之处想要提出建议，并希望了解如何更有效地表达和维护自己的权益，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。