结论前置：员工与公司在协议解除劳动合同时，经济补偿金的计算需综合考虑工作年限、月工资标准及特殊情况下的封顶规定。具体是否支付补偿金，还需看是谁主动提出的解除合同。
一、经济补偿金的基本计算规则
按工作年限计算：
- 每满一年，公司需向员工支付一个月工资作为经济补偿。
- 工作六个月以上但不满一年的，按一年计算，即支付一个月工资。
- 工作不满六个月的，公司需向员工支付半个月工资作为经济补偿。
月工资的定义：
- 月工资是指员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，这包括了计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等所有货币性收入。
二、特殊情况的封顶规定
- 如果员工的月工资高于公司所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿金的标准将按照职工月平均工资的三倍来支付。
- 在这种情况下，支付经济补偿的年限最高不会超过十二年。
三、谁提出解除合同的影响
公司主动提出：
- 如果公司主动提出与员工协商解除劳动合同，那么公司需要按照上述规则支付经济补偿金。
员工主动提出（个人原因）：
- 如果员工因为个人原因主动提出与公司解除劳动合同，那么公司一般不需要支付经济补偿金。
四、具体示例分析
一般情况：
- 假设员工小张在公司工作了4年，月平均工资为6000元，且未超过当地上年度职工月平均工资的三倍。那么，公司与他协商解除劳动合同时应支付的经济补偿金为：\(4年 \times 6000元/年 = 24000元\)。
特殊情况（月工资超过封顶标准）：
- 假设员工小李在公司工作了8年，月平均工资为50000元，而当地上年度职工月平均工资的三倍为35000元。由于小李的月工资超过了封顶标准，因此其经济补偿金的计算基数将按照35000元计算，且支付年限最高不超过十二年。所以，小李应获得的经济补偿金为：\(12年 \times 35000元/年 = 420000元\)（尽管实际工作年限有8年，但由于月工资超过了封顶标准，所以按最高年限12年计算，不过实际支付时会根据具体工作年限和封顶规定综合考量，此处仅为说明封顶原则）。但更准确的计算应是，由于小李工作了8年，且月工资超过封顶标准，所以其经济补偿金为\(8年 \times 35000元/年（封顶标准）= 280000元\)（若按实际工作年限且不超过封顶年限计算）。
五、法律建议
- 在协商解除劳动合同时，无论是公司还是员工，都应明确了解经济补偿金的计算规则和封顶规定，以确保自己的权益得到妥善保护。
- 如果对经济补偿金的计算有疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便在协商过程中做出合理的决策。
六、可能的法律后果
- 如果公司未按照法律规定支付经济补偿金，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司支付应得的经济补偿金及可能的滞纳金或赔偿金。
- 如果员工在协商解除劳动合同时隐瞒了重要事实或提供了虚假信息，导致公司支付了不应支付的经济补偿金，公司有权通过法律途径追回已支付的费用，并可能要求员工承担相应的法律责任。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你有任何其他关于合同纠纷或劳动工伤的问题，都可以直接向我咨询。