公司之间股权转让不交印花税是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国印花税法》：该法明确规定了产权转移书据（包括财产所有权和版权、商标专用权、专利权、专有技术使用权等转移书据，以及股权转让书据）为应税凭证，需缴纳印花税。股权转让协议作为产权转移的一种形式，自然也属于应税范围。
《印花税税目税率表》：作为《印花税法》的附件，明确列出了产权转移书据（包括股权转让书据）属于应税凭证范畴，并规定了相应的税率为价款的万分之五。
二、印花税缴纳的具体规定
纳税人：在股权转让交易中，签订股权转让合同的转让方和受让方都是书立应税凭证的主体，因此双方均需承担纳税义务。
计税依据：股权转让的计税依据为股权转让协议中约定的转让价款。如果转让价格明显偏低且无正当理由，税务机关有权进行核定。
税率：根据《印花税税目税率表》，股权转让所立的书据按照“产权转移书据”税目征收印花税，税率为价款的万分之五。计算公式为：\(应纳税额 = 股权转让价款 \times 0.0005\)。例如，若股权转让价格为100万元，则转让方和受让方各自需缴纳的印花税为500元。
申报与缴纳方式：纳税人应在签订股权转让合同后的次月15日内向主管税务机关申报纳税，可以通过网上申报或前往办税服务厅等方式进行印花税的申报和缴纳。
三、不交印花税的法律后果
法律责任：未按照规定缴纳印花税的行为将构成违法行为，纳税人将面临税务机关的处罚，包括补缴税款、加收滞纳金以及可能的罚款等。
信用影响：不按时缴纳印花税还可能对纳税人的信用记录产生负面影响，影响其未来的融资、招投标等活动。
四、实际操作建议
在进行公司之间股权转让时，双方应确保正确计算并缴纳印花税，以避免可能的法律风险和经济损失。具体来说：
明确转让价款：在股权转让协议中明确约定转让价款，并确保价款合理、公正，避免税务机关进行核定。
及时申报纳税：在签订股权转让合同后的次月15日内向主管税务机关申报纳税，确保按时履行纳税义务。
保留相关凭证：妥善保管股权转让协议、完税凭证等相关文件，以备税务机关查验。
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