协商离职时，补偿金中包含的调休、加班费等，在报税时通常应与补偿金分开处理，不可以直接和补偿金一块报税。以下是对此问题的详细分析：
法律背景与规定
个人所得税法：根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，个人所得税的计税依据是纳税人取得的各项所得。离职补偿金、调休补偿、加班费等均属于个人所得税的应税项目，但它们的计税方式可能有所不同。
离职补偿金：离职补偿金通常属于“工资、薪金所得”范畴，但根据税法规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分，则按照“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。
调休与加班费：调休补偿和加班费则通常直接计入“工资、薪金所得”，按照正常的税率和速算扣除数计算个人所得税。
报税处理
分开报税：由于离职补偿金、调休补偿和加班费在计税方式上存在差异，因此在报税时通常应分开处理。即，离职补偿金按照其特定的计税方式报税，而调休补偿和加班费则按照正常的工资、薪金所得报税。
合并计算的风险：如果将这些费用合并计算并报税，可能会导致计税依据不准确，从而引发税务风险。例如，可能会错误地将超过免税额度的离职补偿金部分也按照较低的税率计税，或者忽略了调休补偿和加班费应缴纳的税款。
实际操作建议
咨询专业机构：在处理离职补偿金、调休补偿和加班费的报税问题时，建议咨询专业的税务机构或会计师事务所，以确保计税依据的准确性和合法性。
保留相关证据：在协商离职和报税过程中，应保留好相关的证据和文件，如离职协议、工资单、加班记录等，以便在需要时提供证明。
及时申报与缴纳：按照税法规定的时间节点及时申报并缴纳个人所得税，避免因逾期申报或缴纳而产生的滞纳金和罚款。
总结来说，协商离职时，补偿金中包含的调休、加班费等应与补偿金分开报税，以确保计税依据的准确性和合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。