有争议的土地不可以擅自耕种。以下从法律背景、法律建议和可能的法律后果三个角度进行详细分析：
法律背景
根据《中华人民共和国土地管理法》第十四条的规定，土地所有权和使用权存在争议时，在争议解决前，任何一方都不得改变土地利用现状。这一规定旨在保护土地权益的合法性，防止因土地争议而引发的进一步纠纷和损失。擅自耕种有争议的土地，实际上是在改变土地利用现状，这违反了上述法律规定。
法律建议
协商解决：首先，建议当事人尝试通过友好协商的方式解决土地争议。在协商过程中，可以明确双方的权利和义务，并签订书面协议以确保协商结果的法律效力。
行政调解：如果协商不成，可以向当地乡（镇）政府或土地管理所等提出处理申请。这些受理机关会进行调解或作出处理决定，这是解决土地争议的重要途径之一。
诉讼解决：对处理决定不服的，当事人可以依法向上一级处理机关申请复议或向人民法院起诉。通过法律手段维护自身合法权益，是解决土地争议的最终途径。
可能的法律后果
法律风险：擅自耕种有争议的土地，可能违反《土地管理法》等相关法律法规。一旦被发现，可能会面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
产权问题：由于土地存在争议，擅自耕种可能导致无法办理合法的土地使用手续。这会影响后续的土地交易、抵押等活动，甚至可能导致土地被收回。
矛盾激化：擅自耕种有争议的土地，会加剧与其他主张该土地权益方的矛盾。这可能引发更多的纠纷和冲突，甚至导致治安问题，不利于社会的和谐稳定。
总结与进一步建议：
有争议的土地不可以擅自耕种，这是法律规定的明确要求。面对土地争议，当事人应当通过合法途径解决，如协商、行政调解或诉讼等。在争议解决之前，务必严格遵守法律法规，不得在争议土地上擅自进行任何耕种或其他活动。如果确实需要使用该土地，建议先通过合法途径解决争议，待土地权属明晰后，再按照法定程序进行申请和使用。
如果您在处理土地争议过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律指导。