合伙项目未经清算，法院确实有可能以亏损不确定为由驳回起诉，但这并非绝对，需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况：未经清算，法院可能驳回起诉
法律依据：
- 根据《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定，合伙企业在解散后应当进行清算，清算的目的是为了终结现存的法律关系、处理剩余财产、清偿债务以及最终消灭合伙企业的资格。在清算结束前，合伙企业的财产状况、债权债务关系等均未明确。
法律后果：
- 如果合伙项目未经清算，合伙人直接起诉要求分割合伙财产或确定盈亏份额，法院可能会认为诉讼请求缺乏事实和法律依据，因为此时无法准确判断合伙项目的盈亏情况，从而可能驳回起诉。例如，在某些案例中，法院明确指出“因双方未对合伙期间的账目进行清算，无法确定盈亏情况”，故驳回了原告的诉讼请求。
二、特殊情况：可基于其他法律关系提起诉讼
尽管一般情况下未经清算不得直接起诉分割财产，但在某些特殊情况下，合伙人可以基于其他法律关系提起诉讼：
退伙纠纷：
- 如果合伙人之间就退伙事宜存在争议，如退伙金的支付、退伙后的责任承担等，可以就此提起诉讼。此时，法院会依据退伙协议或相关法律规定进行裁决，而无需等待合伙项目清算。
侵权纠纷：
- 如果某个合伙人的行为损害了合伙企业或其他合伙人的利益，构成侵权的，受损害的合伙人可以提起侵权之诉。在此情况下，法院会依据侵权责任法等相关法律规定进行裁决，同样无需等待合伙项目清算。
借款纠纷：
- 如果合伙企业与第三人之间存在借款关系，且该借款与合伙事务无关，那么出借人可以基于借款合同关系提起诉讼。此时，法院会依据借款合同和相关法律规定进行裁决，与合伙项目是否清算无关。
三、建议与注意事项
启动清算程序：
- 如果合伙人希望分割合伙财产或确定盈亏份额，应当首先按照法律规定和合伙协议的约定，启动合伙企业的清算程序。这包括成立清算组、通知债权人、清理债权债务、分配剩余财产等步骤。
协商或诉讼解决争议：
- 在清算过程中，如果发现存在争议或纠纷，合伙人可以通过协商或诉讼的方式解决。例如，对于合伙财产的分配比例、债务的承担方式等问题，可以寻求专业律师的帮助或通过司法途径解决。
保留相关证据：
- 在合伙项目运营过程中，合伙人应当保留好相关证据，如合伙协议、账目记录、交易凭证等。这些证据在清算或诉讼过程中将起到至关重要的作用。
及时咨询专业律师：
- 合伙项目涉及的法律问题往往比较复杂，合伙人应当及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律风险。作为专业律师，我可以为你提供全面的法律咨询和解决方案。
综上所述，合伙项目未经清算时，法院是否以亏损不确定为由驳回起诉取决于具体情况。如果合伙人希望维护自己的合法权益，应当遵循法律规定和合伙协议的约定，及时启动清算程序，并在必要时寻求专业律师的帮助。