若发现存在禁止转包的合同实际上被转包的情况，处理方式主要取决于合同约定、法律规定以及各方的具体行为，以下是详细分析：
依据合同约定处理
- 查看合同条款：首先，需要仔细审查原合同中关于转包的条款。如果合同中明确规定了禁止转包，并约定了违约责任，那么转包方将承担违约责任，可能需要支付违约金、赔偿损失等。
- 协商解除或变更合同：在发现转包情况后，发包方可以与转包方进行协商，看是否可以解除原合同或变更合同条款，以消除转包带来的不利影响。
依据法律规定处理
- 认定转包无效：根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，禁止转包的合同如果实际上被转包，该转包行为可能被认定为无效。这意味着转包方与次承包方之间的合同关系不受法律保护，次承包方可能无法依据该合同向转包方主张权利。
- 追究行政责任：对于违法转包的行为，相关行政部门有权进行查处，并可能对转包方处以罚款、吊销资质证书等行政处罚。
- 承担民事责任：转包方因违法转包给发包方造成损失的，应当承担赔偿责任。这包括直接损失和间接损失，如因转包导致的工程质量问题、工期延误等。
实际处理中的注意事项
- 收集证据：在处理转包问题时，收集证据至关重要。这包括原合同、转包合同、付款凭证、沟通记录等，以证明转包事实的存在以及各方的责任。
- 及时采取措施：一旦发现转包情况，发包方应及时采取措施，如发出书面通知要求停止转包、协商解除合同或寻求法律救济等，以防止损失扩大。
- 考虑诉讼或仲裁：如果协商无法解决问题，发包方可以考虑通过诉讼或仲裁等法律途径来维护自己的权益。在选择诉讼或仲裁时，需要根据合同约定、法律规定以及实际情况来综合考虑。
针对您的情况，我建议：
- 仔细审查原合同条款，了解禁止转包的具体规定以及违约责任。
- 与转包方进行沟通，了解转包的具体情况和原因，尝试通过协商解决问题。
- 如果协商无果，及时收集证据并考虑通过法律途径来维护自己的权益。