只有购房合同没有发票，一般是可以进行备案的，但具体情况需结合当地政策及备案要求综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
从备案的基本要求来看：
- 购房备案主要是为了规范房地产市场交易秩序，保障购房者的合法权益，防止开发商“一房多卖”等违规行为。通常情况下，购房备案主要依据的是购房合同，因为购房合同是明确买卖双方权利义务关系的重要法律文件，其中包含了房屋的基本信息、交易价格、付款方式、交房时间等关键内容。只要购房合同是双方真实意思表示，内容合法合规，且符合当地房地产管理部门的相关规定，就可以进行备案。
- 发票主要是作为购房者支付房款的凭证，在税务方面具有重要作用，但它并不是购房备案的必要条件。也就是说，即使没有发票，只要购房合同有效且符合备案要求，就可以办理备案手续。
从实际操作和地方政策差异来看：
- 虽然理论上购房合同是备案的核心依据，但在实际操作中，不同地区的房地产管理部门可能会根据当地的实际情况制定一些具体的备案要求和流程。有些地方可能会要求购房者在备案时提供发票作为辅助材料，以核实购房款的实际支付情况。不过，这种情况并不是普遍存在的，而且即使要求提供发票，如果购房者确实因为某些原因暂时无法取得发票（如开发商尚未开具等），也可以与房地产管理部门进行沟通，说明情况并提供其他相关证明材料，通常也是可以办理备案的。
- 此外，还需要注意的是，如果购房者是通过贷款方式购房的，银行在审批贷款时可能会要求购房者提供发票等材料作为贷款审批的依据之一。但这与购房备案是两个不同的环节，不能混为一谈。
从法律风险和权益保障来看：
- 对于购房者来说，即使没有发票也能办理备案并不意味着可以忽视发票的重要性。发票是购房者支付房款的重要凭证，也是后续办理房产证、缴纳税费等手续时必不可少的材料。因此，购房者在购房后应及时向开发商索取发票，并妥善保管。
- 如果开发商拒绝开具发票或拖延开具发票，购房者可以向当地税务部门投诉举报，维护自己的合法权益。同时，在购房过程中，购房者还应仔细阅读购房合同条款，了解自己的权利和义务，避免因为合同条款不清或开发商违规行为而遭受损失。