针对您提出的“已注销企业存在虚开发票的法律依据”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律地位与责任主体
首先，需要明确的是，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，公司一旦注销，其法人资格即告终止，不再具备民事权利能力和民事行为能力。然而，这并不意味着公司注销后，其存续期间的违法行为就可以逃避法律责任。对于虚开发票这一行为，如果发生在公司注销之前，那么原公司的法定代表人、股东、实际控制人以及直接负责的主管人员和其他直接责任人员，仍然需要承担相应的法律责任。
二、虚开发票的法律责任
行政责任：
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规，虚开发票属于偷税行为。税务机关将追缴虚开的税款，并按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。
- 同时，税务机关还可能对虚开发票的相关责任人员处以罚款，罚款金额根据情节轻重而定，可能包括罚款、吊销执业资格证书等行政处罚。
刑事责任：
- 如果虚开发票行为达到刑事立案标准，如虚开增值税专用发票且税款数额在五万元以上，税务机关将移送案件至公安机关立案侦查。
- 经法院审判，相关责任人可能面临有期徒刑、拘役、罚金乃至没收财产等刑事处罚，具体取决于虚开税款的数额和情节严重程度。
三、税务机关与司法机关的行动
税务机关的调查与认定：
- 税务机关将全面调查已注销公司虚开发票的线索，通过检查交易凭证、资金流水、合同协议及与上下游企业核实等手段，确定虚开事实、涉及金额及发票数量。
司法机关的介入与处理：
- 若虚开发票行为构成犯罪，公安机关将立案侦查，并可能采取拘留、逮捕等强制措施。
- 法院将根据案件事实和法律规定，对相关责任人进行审判，并作出相应的刑事处罚。
四、应对措施与建议
配合调查：
- 原公司的股东、清算组成员及相关财务人员应积极配合税务机关和司法机关的调查，如实提供资料和信息，以避免更严重的法律后果。
主动补缴税款与滞纳金：
- 意识到虚开发票问题后，相关责任主体应主动向税务机关说明情况并补缴税款及滞纳金，以减轻后续可能的处罚。
寻求专业法律帮助：
- 鉴于虚开发票涉及复杂的法律问题，相关责任主体应及时咨询专业律师，了解自身法律责任并获得专业的法律建议和应对策略。
加强合规管理与预防：
- 公司应严格遵守税收法规和发票管理规定，确保所有发票基于真实交易开具。
- 定期进行内部审计，及时发现并纠正不合规行为，防止类似问题发生。
- 加强员工的合规培训，提高团队对税务法规的认识和遵守意识，降低法律风险。
综上所述，已注销企业存在虚开发票的行为，其原公司的相关责任人员仍然需要承担相应的法律责任。因此，建议相关责任主体积极配合调查，主动补缴税款及滞纳金，并寻求专业法律帮助以应对可能的法律后果。同时，公司应加强合规管理，预防类似问题的再次发生。