结论：
- 法律层面：我国现行法律未明确禁止在正规发票备注栏填写借款合同号和借款金额，但需符合《发票管理办法》及其实施细则中关于“发票内容应真实反映交易实质”的核心要求。
- 实务层面：若备注内容与实际交易直接相关（如用于证明资金流向、合同履行等），且不违反税务机关对发票格式的具体规定（如备注栏字数限制），通常可被接受；但若备注内容与交易无关或存在虚构，可能面临发票无效、税务处罚等风险。
详细分析：
一、法律对发票备注栏的核心要求
根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条及第二十二条：
- 真实性原则：发票内容（包括备注栏）需真实反映经济业务的实质，不得虚构或变造。
- 完整性原则：需按税务机关规定的格式开具发票，备注栏虽非必填项，但若填写则需与交易直接相关。
结论延伸：
若借款合同号和借款金额是证明交易真实性的关键信息（如企业间资金拆借需留痕），且备注栏填写后不影响发票其他要素的合规性（如购买方名称、金额、税率等），则法律上无禁止性规定。
二、实务中需注意的风险点
税务机关的审核标准：
- 部分地区税务机关可能对备注栏内容有细化要求（如要求填写“借款利息”而非合同号），若未按规定填写，可能被认定为“发票开具不规范”，导致受票方无法抵扣税款或面临税务稽查。
- 建议：开具前咨询当地税务局或参考其官方发布的《发票开具指南》。
发票用途的合法性：
- 若借款行为本身违法（如高利贷、非法集资），即使发票备注栏填写合规，也可能因交易非法导致发票无效，甚至引发刑事责任。
- 建议：确保借款合同合法有效（如利率符合民间借贷司法解释规定）。
备注栏内容的关联性：
- 备注栏填写的内容需与发票主内容（如“*贷款服务*利息”）直接相关。若填写与交易无关的信息（如个人隐私、无关合同号），可能被认定为“信息滥用”，增加法律风险。
三、操作建议
优先通过合同留痕：
- 借款合同号和金额建议优先在合同中明确约定，并通过银行转账记录（备注借款用途）佐证，而非仅依赖发票备注栏。
备注栏填写规范示例：
- 若需填写，可参考以下格式：
> 备注：借款合同号【XXXXXX】，借款金额【XX元】，借款期限【XX年XX月XX日至XX年XX月XX日】
- 避免填写敏感信息（如身份证号、银行卡号）或无关内容。
企业用户特别注意：
- 若借款方为企业，需确保发票符合“增值税发票抵扣要求”（如贷款服务利息需取得6%税率专票），否则可能无法税前扣除。
总结：发票备注栏填写借款合同号和金额在法律上无明确禁止，但需确保内容真实、与交易相关，并符合当地税务机关的具体要求。若有进一步疑问（如具体地区政策、合同风险防范），可直接向我咨询，我会结合您的交易场景提供更具体的建议。