在基本农田上建厂房是违法的。基本农田是受到法律严格保护的耕地资源，其用途被明确限定为农业生产，不得随意改变用途进行非农业建设。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国土地管理法》：
- 第三十七条明确规定，禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。同时，也禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼，更严禁占用永久基本农田建设畜禽养殖设施、水产养殖设施和破坏耕作层的种植业设施。
- 第七十五条指出，若违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地，将面临限期拆除新建建筑物和其他设施、恢复土地原状的处罚；对符合土地利用总体规划的违法建筑，也将面临没收并处以罚款的严厉惩处。
《基本农田保护条例》：
- 第十七条强调，任何单位和个人不得改变或占用基本农田，国家能源、交通、水利等重点建设项目选址确实无法避开时，必须经国务院批准方可征收。同时，也禁止任何单位和个人在基本农田保护区内建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。
二、违法后果
行政处罚：
- 根据《土地管理法》的规定，非法占用耕地建房的单位或个人，将被责令限期改正或治理，并可能面临耕地开垦费1倍以上2倍以下的罚款。若情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。
刑事责任：
- 若非法占用基本农田数量较大或造成严重破坏，可能触犯刑法第三百四十二条规定的非法占用农用地罪。根据该条款，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
三、合法途径与建议
查询土地性质与规划：
- 在考虑建厂房前，必须明确拟用地块的土地性质和规划用途。可通过向当地自然资源部门咨询或查阅土地利用总体规划图来确认。如果地块被划定为基本农田，则原则上不允许进行非农建设。
申请农用地转用审批：
- 若确需在某地块上建厂房，且该地块非基本农田或已通过合法程序转变为可用于工业建设的土地，则需依法申请农用地转用审批。这包括提出申请、审查与上报、批准与实施等步骤。
考虑其他选址方案：
- 若难以将基本农田转变为工业用地，或转变过程复杂耗时，应考虑在其他合适位置寻找建厂房地点。确保新址的合法性和符合产业规划及环保要求。
严格遵守法律法规：
- 在整个过程中，必须严格遵守土地管理、环境保护等相关法律法规。任何未经批准的土地用途变更或非法建设行为都将面临法律责任。
总结与建议：基本农田是受到法律严格保护的耕地资源，不得随意改变用途进行非农业建设。若需在农村土地上建厂房，应优先选择非基本农田地块，并依法办理相关审批手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。