关于“交通事故主要责任免于起诉单位是否会处分”的问题，结论需分情况讨论，具体如下：

1. 若“免于起诉”是司法机关依法作出的决定
   根据《刑事诉讼法》第十六条、第一百七十七条第二款规定，若交通事故案件符合“情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪”或“犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚”等情形，检察机关可作出不起诉决定。此时，单位通常不会因司法机关的“免于起诉”决定直接对员工进行处分，因为司法机关已认定行为不构成犯罪或无需追究刑事责任，单位无权以“刑事犯罪”为由处罚员工。
   但需注意：若单位规章制度明确规定“员工因交通事故被追究行政责任（如交警认定主要责任）即构成严重违纪”，则单位可能依据内部规定给予警告、记过等处分（需符合《劳动合同法》第三十九条关于“严重违反规章制度”的解雇条件）。此时处分依据是行政责任，而非刑事责任。

2. 若“免于起诉”是单位与受害方协商的结果（如私了）
   若员工与受害方私下达成赔偿协议，受害方未向公安机关报案或检察机关未介入，此时“免于起诉”并非司法程序结果，而是民事和解。单位是否处分取决于内部规定：

   • 若单位规章制度明确“员工因交通事故负主要责任且造成单位损失（如车辆维修费、赔偿款等）需承担部分责任”，则可能要求员工赔偿或给予处分；
     
   • 若单位无相关规定，或事故未影响单位利益（如员工私车发生事故），则单位通常无权处分。

3. 单位处分的合法性边界
   根据《劳动合同法》第三十九条，单位仅在员工“被依法追究刑事责任”时可直接解除劳动合同；若仅涉及行政责任或民事赔偿，单位需证明员工行为“严重违反规章制度”才能处分。例如：

   • 员工因交通事故主要责任被交警罚款、扣分，但未被拘留或起诉，单位若以此解雇，需证明规章制度中明确“交通违章扣分达XX分即属严重违纪”，且该规定已向员工公示；
     
   • 若单位无法证明，则处分可能被认定为违法，员工可申请劳动仲裁要求赔偿。

建议：

• 若您已收到单位处分通知，需核对单位规章制度是否明确相关条款，并确认处分程序是否合法（如是否经工会或职工代表大会同意）；
  
• 若单位以“免于起诉”为由处分，但司法机关未实际作出不起诉决定，可要求单位提供证据；
  
• 如有争议，建议收集交警责任认定书、单位规章制度、处分通知等材料，进一步向我咨询具体维权方案。
  

（如有其他细节需补充，可直接告知我，我会结合具体案情为您分析。）