员工不胜任工作辞退是否合法，需视具体情况而定，但总体来说，在一定条件下是合法的，不过必须严格遵守相关法律法规的规定和程序。以下是对此问题的详细分析：
合法辞退的条件与程序
明确证据支持：
- 公司必须提供充分且明确的证据来证明员工确实不能胜任其本职工作。这些证据可以包括员工的工作表现记录、绩效评估报告、定期的业绩考核记录以及工作失误造成的损失等客观数据。
- 不能胜任的判断应基于与工作直接相关的因素，如工作能力、技能水平等，而非主观偏见或不合理要求。例如，若员工因疏忽导致重大经济损失，且有相关证据支持，则可视为不能胜任工作。
培训或调岗义务：
- 在确认员工不能胜任工作后，公司需为员工提供针对性的岗位培训，以帮助其提升工作能力，或者将其调整至更适合的岗位。
- 培训内容应与员工的工作短板紧密相关，调岗也需合理且不得带有惩罚性质。例如，若员工在销售岗位表现不佳，公司可提供销售技巧培训或将其调至客服岗位。
再次考核与确认：
- 经过培训或调岗后，公司需对员工进行再次考核，以确认其是否仍不能胜任工作。
- 若员工再次被证明不能胜任，则公司可依据相关规定进行辞退。考核过程应公正、公开，确保考核结果的客观性。
履行法定程序：
- 公司需提前通知工会（如有）并说明辞退原因及依据，听取工会意见。
- 按照法律规定的时间和方式，提前三十日以书面形式通知员工本人，或额外支付一个月工资作为代通知金。例如，若公司决定辞退员工，需在三十日前向员工发出书面通知，或支付一个月工资作为补偿。
- 依法向员工支付经济补偿金，根据员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准。计算公式为：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资。其中，月工资指劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
违法辞退的情形
- 缺乏充分证据：若公司无法提供足够证据证明员工不能胜任工作，仅凭口头声称或模糊不清的标准判断，则辞退行为违法。
- 未履行培训或调岗程序：未经培训或调岗直接辞退员工，属于违法解除劳动合同。例如，若公司仅凭一次业绩考核不达标即认定员工不胜任工作，且未进行培训或调整岗位，也未提前通知，则构成违法解除劳动合同。
- 违反法定程序：未按规定通知工会或员工本人，或通知形式和时间不符合规定，均构成违法辞退。
员工权益保护
- 若员工认为公司以不能胜任工作为由的辞退行为违法，可与公司协商解决。
- 协商不成时，员工可向劳动争议仲裁机构申请仲裁，对仲裁结果不满意还可向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。例如，员工可申请劳动仲裁，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金，赔偿金标准为经济补偿标准的二倍。
总结来说，公司以不能胜任工作为由辞退员工，在符合上述合法条件与程序时是合法的。然而，公司必须严格遵守相关法律法规，确保辞退行为的合法性，否则将承担相应的法律责任。同时，员工也应了解自己的权益，并在必要时采取法律手段维护自身利益。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。