在工程纠纷案件中，确定应付款时间是一个核心且复杂的问题，它涉及到合同约定、法律规定以及行业习惯等多个方面。以下是我为您提供的详细解答：

一、合同约定是首要依据

1. 明确付款条款：

   • 首先，应仔细审查建设工程施工合同中关于付款时间的具体条款。例如，合同中可能明确规定了“工程竣工验收合格后30日内支付工程款”等具体日期或条件。
   • 若合同中存在分期付款的约定，需分别确认各期款项的支付条件和时间节点，如“主体结构完工后支付至总价的60%”等。

2. 关注附条件条款：

   • 付款时间可能与验收、审计等程序挂钩。例如，合同可能规定“审计完成后支付尾款”。在此情况下，需核实相关程序的完成时间。
   • 若因发包方拖延导致审计滞后，承包人可根据合同及相关法律规定，主张按合理期限计算付款时间。

3. 约定不明或补充协议：

   • 若合同对支付时间约定不明确，双方应首先通过协商达成补充协议。
   • 若无法达成补充协议，可结合合同其他相关条款或建筑行业交易习惯来推断支付时间。

二、法律强制性规定的补充作用

1. 利息起算规则：

   • 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》，若合同未约定付款时间或约定不明，利息从工程交付之日或提交竣工结算文件之日起计算。
   • 若工程未交付且未结算，则从起诉之日起计算利息。

2. 优先受偿权时效：

   • 承包人需在工程竣工之日起一定期限内（如18个月）行使优先受偿权，此期限可能影响工程款支付的紧迫性。

三、行业习惯与惯例的辅助判断

1. 进度款支付周期：

   • 建筑行业通常按月或分阶段支付进度款。例如，每月25日提交工程量报告，次月10日前支付进度款。若无书面约定，可参考此类行业惯例。

2. 竣工验收流程：

   • 竣工验收一般需经施工单位自检、监理初验、发包方终验等环节。若合同未明确验收时限，可按行业平均周期（如7-14个工作日）推定付款时间。

四、特殊情形的处理原则

1. 工程变更：

   • 若工程变更导致工程款增加，增加部分工程款的支付时间应根据变更协议或补充协议确定。无约定的，参照上述原则确定。

2. 发包方拖延验收：

   • 若发包方故意拖延验收，影响工程款支付时间，承包人可根据相关法律规定和证据，主张以提交竣工验收报告之日为竣工日期，并以此确定支付时间。

3. 不可抗力影响：

   • 如因疫情等不可抗力因素导致停工，可根据政府通知或双方协商文件调整付款时间表。

五、实操建议

1. 合同条款优化：

   • 在签订合同时，应明确付款时间节点的具体标准，如“验收合格”需定义为发包方签字确认等，避免模糊表述。

2. 定期对账机制：

   • 建立月度或季度对账制度，及时确认已完成工程量和应付金额，减少事后争议。

3. 保留关键证据：

   • 施工日志、验收记录、付款申请单、往来函件、会议纪要、审计报告等均可作为时间点的证明材料，应妥善保管。

综上所述，工程款支付时间的确定需严格遵循合同约定，并在合同无约定或约定不明时，参照相关法律规定及行业习惯。同时，还需特别注意特殊规定对支付时间的影响，以确保工程款的及时、合法支付。在处理工程纠纷案件时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律指导。