果农承包用地建农用房是否需要缴纳占地费，需分情况讨论，核心判断依据为土地性质、审批手续及地方政策，具体分析如下：

1. 若土地性质为农用地且符合规划用途
   根据《土地管理法》第四十四条，农用地转为建设用地需依法办理转用审批手续。若果农承包的土地性质为农用地（如耕地、园地），且建房用途符合农业附属设施用地（如看护房、仓储房等），且已通过乡镇政府审核、县级自然资源部门备案，则属于合法用地，无需缴纳占地费，但需按地方标准缴纳土地复垦保证金（用于拆除后恢复耕作条件）。

2. 若土地性质为建设用地或已依法转用
   若承包地已通过合法程序转为集体建设用地（如乡村规划中的“设施农用地”），或果农已取得《乡村建设规划许可证》，则建房行为合法，无需额外缴纳占地费，但可能需支付土地使用费（如集体土地租赁费用，具体由承包合同约定）。

3. 未履行审批手续的违法用地情形
   若果农未申请用地审批或超出审批范围建房，根据《土地管理法》第七十七条，可能面临：

   • 责令退还土地、限期拆除房屋；
     
   • 按非法占用土地面积处以罚款（如耕地每平方米30元以下）；
     
   • 若地方政策规定违法用地需补缴占地费，则可能被追缴费用（但此费用性质为行政处罚，非合法用地下的常规收费）。

实务建议：

• 建房前务必确认土地性质（可通过当地自然资源局查询土地利用总体规划图）；
  
• 依法办理设施农用地备案或乡村建设规划许可；
  
• 避免以“农用房”名义建设住宅或商业用房，否则可能被认定为改变土地用途，面临更高处罚。
  

如有具体案例细节（如土地性质、建房规模、地方政策等），可进一步向我咨询，我将结合《土地管理法实施条例》及地方性法规提供针对性分析。