核心结论：医疗期满后，若您持有医院出具的合法假条，单位却按旷工处理并寄送挂号信，您可以通过以下步骤维护自身权益。

1. 核实假条的合法性与有效性
   首先，确认您持有的医院假条是否符合法律规定的形式要件（如加盖医院公章、医生签名、明确建议休息期限等）。若假条真实有效，单位无权单方面认定您旷工。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期内用人单位不得解除劳动合同，且需根据医院证明安排病假。

2. 书面回应单位的旷工认定
   收到挂号信后，立即以书面形式（如EMS）向单位回复，附上医院假条复印件，明确说明：

   • 您仍处于医疗期内，且有合法假条；
     
   • 单位单方面认定旷工的行为违法；
     
   • 要求单位撤销旷工决定，恢复工资待遇及岗位。
     （保留寄送凭证，如快递底单、签收记录）

3. 向劳动监察部门投诉
   若单位拒不改正，可向当地劳动保障监察大队投诉，提交以下材料：

   • 医院假条原件及复印件；
     
   • 单位寄送的旷工认定挂号信；
     
   • 劳动合同、工资流水等证明劳动关系的材料。
     监察部门将介入调查，责令单位纠正违法行为。

4. 申请劳动仲裁
   若投诉无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张：

   • 单位违法解除劳动合同（若单位以旷工为由开除您）；
     
   • 补发医疗期工资差额；
     
   • 恢复劳动关系或支付赔偿金。
     （仲裁时效为1年，自知道权益受损之日起计算）

5. 注意事项

   • 医疗期期限：根据工龄和社保缴纳年限，医疗期一般为3-24个月，具体以当地规定为准。若医疗期已满但仍需治疗，可申请延长，但需医院出具证明。
     
   • 单位举证责任：若单位主张您旷工，需提供您未履行请假手续的证据（如未提交假条、拒绝返岗通知等）。若您已提交假条，单位无法举证，则其主张不成立。
     
   • 避免被动离职：医疗期内单位不得以“不能胜任工作”“客观情况重大变化”等理由解除合同，否则构成违法解除。

行动建议：优先与单位协商，若协商无果，尽快启动投诉或仲裁程序。医疗期权益受法律严格保护，无需因单位压力放弃合法主张。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。